RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570391.5

PCYT2-205, Transcript of phosphate cytidylyltransferase 2, ethanolamine, human

TSL 2 BASIC

Gene PCYT2, Length 1,857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCYT2-205	ENST00000570391	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.79	■■■■■ 4.6
PCYT2-205	ENST00000570391	GLI2	P10070	1586 aa		43.78	■■■■■ 4.6
PCYT2-205	ENST00000570391	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.77	■■■■■ 4.6
PCYT2-205	ENST00000570391	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.77	■■■■■ 4.6
PCYT2-205	ENST00000570391	PLCH2	O75038	1416 aa		43.76	■■■■■ 4.6
PCYT2-205	ENST00000570391	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.72	■■■■■ 4.59
PCYT2-205	ENST00000570391	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.7	■■■■■ 4.59
PCYT2-205	ENST00000570391	ITGAE	P38570	1179 aa		43.66	■■■■■ 4.58
PCYT2-205	ENST00000570391	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.66	■■■■■ 4.58
PCYT2-205	ENST00000570391	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		43.64	■■■■■ 4.58
PCYT2-205	ENST00000570391	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.64	■■■■■ 4.58
PCYT2-205	ENST00000570391	FANCA	O15360	1455 aa		43.64	■■■■■ 4.58
PCYT2-205	ENST00000570391	MIA2	Q96PC5	1412 aa		43.64	■■■■■ 4.58
PCYT2-205	ENST00000570391	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	43.59	■■■■■ 4.57
PCYT2-205	ENST00000570391	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.59	■■■■■ 4.57
PCYT2-205	ENST00000570391	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.56	■■■■■ 4.56
PCYT2-205	ENST00000570391	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
PCYT2-205	ENST00000570391	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.53	■■■■■ 4.56
PCYT2-205	ENST00000570391	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		43.52	■■■■■ 4.56
PCYT2-205	ENST00000570391	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.52	■■■■■ 4.56
PCYT2-205	ENST00000570391	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		43.51	■■■■■ 4.56
PCYT2-205	ENST00000570391	AKNA	Q7Z591	1439 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PCYT2-205	ENST00000570391	ABCC1	P33527	1531 aa		43.45	■■■■■ 4.55
PCYT2-205	ENST00000570391	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.44	■■■■■ 4.54
PCYT2-205	ENST00000570391	PTPRK	Q15262	1439 aa		43.41	■■■■■ 4.54
PCYT2-205	ENST00000570391	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PCYT2-205	ENST00000570391	MBD5	Q9P267	1494 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PCYT2-205	ENST00000570391	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		43.38	■■■■■ 4.54
PCYT2-205	ENST00000570391	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.38	■■■■■ 4.54
PCYT2-205	ENST00000570391	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		43.36	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	ABCC5	O15440	1437 aa		43.35	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	NEO1	Q92859	1461 aa		43.35	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.34	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		43.34	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	DAPK1	P53355	1430 aa		43.34	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	RAPGEF3	O95398	923 aa		43.32	■■■■■ 4.53
PCYT2-205	ENST00000570391	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.31	■■■■■ 4.52
PCYT2-205	ENST00000570391	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.28	■■■■■ 4.52
PCYT2-205	ENST00000570391	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.27	■■■■■ 4.52
PCYT2-205	ENST00000570391	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	43.26	■■■■■ 4.52
PCYT2-205	ENST00000570391	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PCYT2-205	ENST00000570391	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PCYT2-205	ENST00000570391	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.22	■■■■■ 4.51
PCYT2-205	ENST00000570391	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PCYT2-205	ENST00000570391	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
PCYT2-205	ENST00000570391	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PCYT2-205	ENST00000570391	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PCYT2-205	ENST00000570391	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.14	■■■■■ 4.5
PCYT2-205	ENST00000570391	RICTOR	Q6R327	1708 aa		43.13	■■■■■ 4.49
PCYT2-205	ENST00000570391	TSPY4	P0CV99	314 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PCYT2-205	ENST00000570391	TSPY10	P0CW01	314 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PCYT2-205	ENST00000570391	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PCYT2-205	ENST00000570391	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PCYT2-205	ENST00000570391	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.49
PCYT2-205	ENST00000570391	KDM5C	P41229	1560 aa		43.03	■■■■■ 4.48
PCYT2-205	ENST00000570391	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		43.02	■■■■■ 4.48
PCYT2-205	ENST00000570391	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.02	■■■■■ 4.48
PCYT2-205	ENST00000570391	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PCYT2-205	ENST00000570391	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	KDM6B	O15054	1643 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.95	■■■■■ 4.47
PCYT2-205	ENST00000570391	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.94	■■■■■ 4.46
PCYT2-205	ENST00000570391	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.94	■■■■■ 4.46
PCYT2-205	ENST00000570391	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PCYT2-205	ENST00000570391	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PCYT2-205	ENST00000570391	NAIP	Q13075	1403 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PCYT2-205	ENST00000570391	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PCYT2-205	ENST00000570391	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PCYT2-205	ENST00000570391	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PCYT2-205	ENST00000570391	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PCYT2-205	ENST00000570391	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PCYT2-205	ENST00000570391	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PCYT2-205	ENST00000570391	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.83	■■■■■ 4.45
PCYT2-205	ENST00000570391	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.82	■■■■■ 4.44
PCYT2-205	ENST00000570391	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PCYT2-205	ENST00000570391	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PCYT2-205	ENST00000570391	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PCYT2-205	ENST00000570391	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PCYT2-205	ENST00000570391	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PCYT2-205	ENST00000570391	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PCYT2-205	ENST00000570391	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PCYT2-205	ENST00000570391	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PCYT2-205	ENST00000570391	A2M	P01023	1474 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PCYT2-205	ENST00000570391	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PCYT2-205	ENST00000570391	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
PCYT2-205	ENST00000570391	ATP10A	O60312	1499 aa		42.57	■■■■■ 4.41
PCYT2-205	ENST00000570391	KIF3B	O15066	747 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PCYT2-205	ENST00000570391	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.53	■■■■■ 4.4	1e-8	■■□□□ 11.9
PCYT2-205	ENST00000570391	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.53	■■■■■ 4.4
PCYT2-205	ENST00000570391	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.52	■■■■■ 4.4
PCYT2-205	ENST00000570391	MLEC	Q14165	292 aa		42.44	■■■■■ 4.38
PCYT2-205	ENST00000570391	GGT6	Q6P531	493 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PCYT2-205	ENST00000570391	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
PCYT2-205	ENST00000570391	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
PCYT2-205	ENST00000570391	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.36	■■■■■ 4.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms