RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PKD1-238	ENST00000570150	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PKD1-238	ENST00000570150	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PKD1-238	ENST00000570150	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PKD1-238	ENST00000570150	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PKD1-238	ENST00000570150	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PKD1-238	ENST00000570150	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PKD1-238	ENST00000570150	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PKD1-238	ENST00000570150	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PKD1-238	ENST00000570150	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PKD1-238	ENST00000570150	ABCC1	P33527	1531 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PKD1-238	ENST00000570150	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PKD1-238	ENST00000570150	KDM5C	P41229	1560 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PKD1-238	ENST00000570150	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PKD1-238	ENST00000570150	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	ATP10A	O60312	1499 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.95	■■■□□ 2.07
PKD1-238	ENST00000570150	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PKD1-238	ENST00000570150	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PKD1-238	ENST00000570150	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PKD1-238	ENST00000570150	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PKD1-238	ENST00000570150	PTPRM	P28827	1452 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PKD1-238	ENST00000570150	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PKD1-238	ENST00000570150	AGL	P35573	1532 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PKD1-238	ENST00000570150	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PKD1-238	ENST00000570150	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PKD1-238	ENST00000570150	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PKD1-238	ENST00000570150	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PKD1-238	ENST00000570150	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PKD1-238	ENST00000570150	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PKD1-238	ENST00000570150	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	A2M	P01023	1474 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	MLEC	Q14165	292 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PKD1-238	ENST00000570150	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PKD1-238	ENST00000570150	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PKD1-238	ENST00000570150	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PKD1-238	ENST00000570150	DAPK1	P53355	1430 aa		27.56	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.55	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	ABCC5	O15440	1437 aa		27.54	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.53	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.53	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.53	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PKD1-238	ENST00000570150	KIF3B	O15066	747 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PKD1-238	ENST00000570150	GGT6	Q6P531	493 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PKD1-238	ENST00000570150	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PKD1-238	ENST00000570150	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PKD1-238	ENST00000570150	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PKD1-238	ENST00000570150	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PKD1-238	ENST00000570150	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PKD1-238	ENST00000570150	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PKD1-238	ENST00000570150	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PKD1-238	ENST00000570150	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PKD1-238	ENST00000570150	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PKD1-238	ENST00000570150	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.4	■■□□□ 1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms