RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-211ENST00000568829 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-211ENST00000568829 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRMP28827 1452 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-211ENST00000568829 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-211ENST00000568829 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-211ENST00000568829 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-211ENST00000568829 ATP10AO60312 1499 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-211ENST00000568829 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-211ENST00000568829 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-211ENST00000568829 MADDQ8WXG6 1647 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-211ENST00000568829 AFAP1Q8N556 730 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-211ENST00000568829 MLECQ14165 292 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-211ENST00000568829 PREX2Q70Z35 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-211ENST00000568829 KDM5CP41229 1560 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-211ENST00000568829 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS1-211ENST00000568829 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS1-211ENST00000568829 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC1P33527 1531 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 CEP162Q5TB80 1403 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 REREQ9P2R6 1566 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.45■■□□□ 1.83
SPNS1-211ENST00000568829 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 AGLP35573 1532 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 ABCA6Q8N139 1617 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS1-211ENST00000568829 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-211ENST00000568829 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-211ENST00000568829 HSPA2P54652 639 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS1-211ENST00000568829 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 ATP7AQ04656 1500 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 TIAM1Q13009 1591 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-211ENST00000568829 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.27■■□□□ 1.8
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SPNS1-211ENST00000568829 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 A2MP01023 1474 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 NCOA2Q15596 1464 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 FBXO41Q8TF61 875 aa26.22■■□□□ 1.79
SPNS1-211ENST00000568829 MBD5Q9P267 1494 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 APLP2Q06481 763 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 TSPY4P0CV99 314 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 TSPY10P0CW01 314 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 GGT6Q6P531 493 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 C3P01024 1663 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K1Q13233 1512 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 PLXNC1O60486 1568 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-211ENST00000568829 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.15■■□□□ 1.78
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SPNS1-211ENST00000568829 MROH2AA6NES4 1674 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-211ENST00000568829 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS1-211ENST00000568829 MIA2Q96PC5 1412 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS1-211ENST00000568829 KIF3BO15066 747 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-211ENST00000568829 CERKQ8TCT0 537 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-211ENST00000568829 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SPNS1-211ENST00000568829 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SPNS1-211ENST00000568829 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26■■□□□ 1.75
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRTO14522 1441 aa26■■□□□ 1.75
SPNS1-211ENST00000568829 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26■■□□□ 1.75
SPNS1-211ENST00000568829 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRKQ15262 1439 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-211ENST00000568829 NCOA1Q15788 1441 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-211ENST00000568829 STRCQ7RTU9 1775 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-211ENST00000568829 PKD2Q13563 968 aa25.93■■□□□ 1.74
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