RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 POGZQ7Z3K3 1410 aa47.21■■■■■ 5.15
RAB40C-211ENST00000568586 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.18■■■■■ 5.14
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.18■■■■■ 5.14
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47.17■■■■■ 5.14
RAB40C-211ENST00000568586 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.13■■■■■ 5.13
RAB40C-211ENST00000568586 PREX2Q70Z35 1606 aa47.11■■■■■ 5.13
RAB40C-211ENST00000568586 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa47.05■■■■■ 5.12
RAB40C-211ENST00000568586 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.05■■■■■ 5.12
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa47.02■■■■■ 5.12
RAB40C-211ENST00000568586 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.01■■■■■ 5.12
RAB40C-211ENST00000568586 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.99■■■■■ 5.11
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RAB40C-211ENST00000568586 AFAP1Q8N556 730 aa46.94■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC1P33527 1531 aa46.94■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.93■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.91■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.89■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.89■■■■■ 5.1
RAB40C-211ENST00000568586 ATP10AO60312 1499 aa46.88■■■■■ 5.09
RAB40C-211ENST00000568586 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.85■■■■■ 5.09
RAB40C-211ENST00000568586 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.84■■■■■ 5.09
RAB40C-211ENST00000568586 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.83■■■■■ 5.09
RAB40C-211ENST00000568586 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.82■■■■■ 5.09
RAB40C-211ENST00000568586 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.81■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRMP28827 1452 aa46.79■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.79■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.78■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.77■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.76■■■■■ 5.08
RAB40C-211ENST00000568586 MADDQ8WXG6 1647 aa46.74■■■■■ 5.07
RAB40C-211ENST00000568586 TIAM1Q13009 1591 aa46.73■■■■■ 5.07
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.71■■■■■ 5.07
RAB40C-211ENST00000568586 REREQ9P2R6 1566 aa46.68■■■■■ 5.06
RAB40C-211ENST00000568586 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.68■■■■■ 5.06
RAB40C-211ENST00000568586 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.66■■■■■ 5.06
RAB40C-211ENST00000568586 MAP3K1Q13233 1512 aa46.65■■■■■ 5.06
RAB40C-211ENST00000568586 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.62■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 NCOA2Q15596 1464 aa46.62■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 ABCA6Q8N139 1617 aa46.61■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.6■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.6■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.59■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
RAB40C-211ENST00000568586 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
RAB40C-211ENST00000568586 MLECQ14165 292 aa46.53■■■■■ 5.04
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
RAB40C-211ENST00000568586 AGLP35573 1532 aa46.52■■■■■ 5.04
RAB40C-211ENST00000568586 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
RAB40C-211ENST00000568586 MBD5Q9P267 1494 aa46.5■■■■■ 5.03
RAB40C-211ENST00000568586 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.02
RAB40C-211ENST00000568586 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.43■■■■■ 5.02
RAB40C-211ENST00000568586 ATP7AQ04656 1500 aa46.42■■■■■ 5.02
RAB40C-211ENST00000568586 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
RAB40C-211ENST00000568586 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.32■■■■■ 5.01
RAB40C-211ENST00000568586 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.32■■■■■ 5.01
RAB40C-211ENST00000568586 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.32■■■■■ 5.01
RAB40C-211ENST00000568586 PLXNC1O60486 1568 aa46.26■■■■■ 5
RAB40C-211ENST00000568586 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.25■■■■■ 5
RAB40C-211ENST00000568586 A2MP01023 1474 aa46.25■■■■■ 4.99
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.25■■■■■ 4.99
RAB40C-211ENST00000568586 APLP2Q06481 763 aa46.23■■■■■ 4.99
RAB40C-211ENST00000568586 MIA2Q96PC5 1412 aa46.2■■■■■ 4.99
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.2■■■■■ 4.99
RAB40C-211ENST00000568586 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.2■■■■■ 4.99
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RAB40C-211ENST00000568586 PLPPR3Q6T4P5 718 aa46.15■■■■■ 4.98
RAB40C-211ENST00000568586 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP46.14■■■■■ 4.98
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RAB40C-211ENST00000568586 TSPY10P0CW01 314 aa46.04■■■■■ 4.96
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RAB40C-211ENST00000568586 C3P01024 1663 aa46.01■■■■■ 4.96
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RAB40C-211ENST00000568586 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.96■■■■■ 4.95
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RAB40C-211ENST00000568586 HSPA2P54652 639 aa45.93■■■■■ 4.94
RAB40C-211ENST00000568586 ZMYM3Q14202 1370 aa45.93■■■■■ 4.94
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RAB40C-211ENST00000568586 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.86■■■■■ 4.93
RAB40C-211ENST00000568586 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa45.86■■■■■ 4.93
RAB40C-211ENST00000568586 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.85■■■■■ 4.93
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RAB40C-211ENST00000568586 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.92
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC5O15440 1437 aa45.78■■■■■ 4.92
RAB40C-211ENST00000568586 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.77■■■■■ 4.92
RAB40C-211ENST00000568586 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.76■■■■■ 4.92
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRKQ15262 1439 aa45.72■■■■■ 4.91
RAB40C-211ENST00000568586 DAPK1P53355 1430 aa45.69■■■■■ 4.9
RAB40C-211ENST00000568586 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
RAB40C-211ENST00000568586 CROCC2H7BZ55 1655 aa45.66■■■■■ 4.9
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