RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
RBBP6-211ENST00000568316 NEO1Q92859 1461 aa38.64■■■■□ 3.78
RBBP6-211ENST00000568316 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.62■■■■□ 3.77
RBBP6-211ENST00000568316 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.61■■■■□ 3.77
RBBP6-211ENST00000568316 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.58■■■■□ 3.77
RBBP6-211ENST00000568316 AKNAQ7Z591 1439 aa38.57■■■■□ 3.77
RBBP6-211ENST00000568316 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
RBBP6-211ENST00000568316 KDM6BO15054 1643 aa38.56■■■■□ 3.76
RBBP6-211ENST00000568316 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.55■■■■□ 3.76
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
RBBP6-211ENST00000568316 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRL1O94910 1474 aa38.5■■■■□ 3.75
RBBP6-211ENST00000568316 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.49■■■■□ 3.75
RBBP6-211ENST00000568316 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.46■■■■□ 3.75
RBBP6-211ENST00000568316 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.44■■■■□ 3.74
RBBP6-211ENST00000568316 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
RBBP6-211ENST00000568316 ABCC1P33527 1531 aa38.42■■■■□ 3.74
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
RBBP6-211ENST00000568316 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
RBBP6-211ENST00000568316 RAPGEF3O95398 923 aa38.39■■■■□ 3.74
RBBP6-211ENST00000568316 MIA2Q96PC5 1412 aa38.37■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.36■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.35■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.35■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.34■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.34■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.33■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.33■■■■□ 3.73
RBBP6-211ENST00000568316 RICTORQ6R327 1708 aa38.32■■■■□ 3.72
RBBP6-211ENST00000568316 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.3■■■■□ 3.729e-7■□□□□ 8.7
RBBP6-211ENST00000568316 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.29■■■■□ 3.72
RBBP6-211ENST00000568316 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.29■■■■□ 3.72
RBBP6-211ENST00000568316 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.27■■■■□ 3.72
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.25■■■■□ 3.71
RBBP6-211ENST00000568316 AFAP1Q8N556 730 aa38.25■■■■□ 3.71
RBBP6-211ENST00000568316 MBD5Q9P267 1494 aa38.21■■■■□ 3.71
RBBP6-211ENST00000568316 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
RBBP6-211ENST00000568316 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.17■■■■□ 3.7
RBBP6-211ENST00000568316 KDM5CP41229 1560 aa38.17■■■■□ 3.7
RBBP6-211ENST00000568316 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.12■■■■□ 3.69
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.12■■■■□ 3.69
RBBP6-211ENST00000568316 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.1■■■■□ 3.69
RBBP6-211ENST00000568316 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.09■■■■□ 3.69
RBBP6-211ENST00000568316 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.06■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.06■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.06■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.06■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.04■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.03■■■■□ 3.68
RBBP6-211ENST00000568316 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 ABCC5O15440 1437 aa38■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.99■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 ATP7AQ04656 1500 aa37.99■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 DAPK1P53355 1430 aa37.99■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 TSPY4P0CV99 314 aa37.97■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 TSPY10P0CW01 314 aa37.97■■■■□ 3.67
RBBP6-211ENST00000568316 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.95■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 ABCA6Q8N139 1617 aa37.94■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.93■■■■□ 3.668e-13■■□□□ 13.2
RBBP6-211ENST00000568316 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.93■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.93■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.92■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.9■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.9■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 ATP10AO60312 1499 aa37.89■■■■□ 3.66
RBBP6-211ENST00000568316 ITGAEP38570 1179 aa37.87■■■■□ 3.65
RBBP6-211ENST00000568316 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.85■■■■□ 3.65
RBBP6-211ENST00000568316 PTPRKQ15262 1439 aa37.81■■■■□ 3.64
RBBP6-211ENST00000568316 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.77■■■■□ 3.64
RBBP6-211ENST00000568316 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.77■■■■□ 3.64
RBBP6-211ENST00000568316 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
RBBP6-211ENST00000568316 A2MP01023 1474 aa37.76■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 PLXNC1O60486 1568 aa37.76■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 REREQ9P2R6 1566 aa37.75■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.72■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.72■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRL2O95490 1459 aa37.71■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 KIF15Q9NS87 1388 aa37.7■■■■□ 3.63
RBBP6-211ENST00000568316 NCOA1Q15788 1441 aa37.69■■■■□ 3.62
RBBP6-211ENST00000568316 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
RBBP6-211ENST00000568316 AGLP35573 1532 aa37.64■■■■□ 3.62
RBBP6-211ENST00000568316 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.62■■■■□ 3.61
RBBP6-211ENST00000568316 ROCK1Q13464 1354 aa37.62■■■■□ 3.61
RBBP6-211ENST00000568316 MLECQ14165 292 aa37.61■■■■□ 3.61
RBBP6-211ENST00000568316 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.56■■■■□ 3.6
RBBP6-211ENST00000568316 KIF3BO15066 747 aa37.54■■■■□ 3.6
RBBP6-211ENST00000568316 ERBINQ96RT1 1412 aa37.52■■■■□ 3.6
RBBP6-211ENST00000568316 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.48■■■■□ 3.59
RBBP6-211ENST00000568316 GGT6Q6P531 493 aa37.47■■■■□ 3.59
RBBP6-211ENST00000568316 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.45■■■■□ 3.59
RBBP6-211ENST00000568316 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.45■■■■□ 3.59
RBBP6-211ENST00000568316 MADDQ8WXG6 1647 aa37.41■■■■□ 3.58
RBBP6-211ENST00000568316 NAIPQ13075 1403 aa37.41■■■■□ 3.58
RBBP6-211ENST00000568316 HFM1A2PYH4 1435 aa37.4■■■■□ 3.58
RBBP6-211ENST00000568316 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms