RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567595.1

LMF1-210, Transcript of lipase maturation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMF1, Length 663 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-210ENST00000567595 PREX2Q70Z35 1606 aa28.82■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.82■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.81■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.8■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.78■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.78■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.77■■■□□ 2.2
LMF1-210ENST00000567595 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.76■■■□□ 2.19
LMF1-210ENST00000567595 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.75■■■□□ 2.19
LMF1-210ENST00000567595 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.73■■■□□ 2.19
LMF1-210ENST00000567595 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
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LMF1-210ENST00000567595 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.69■■■□□ 2.18
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LMF1-210ENST00000567595 KDM5CP41229 1560 aa28.67■■■□□ 2.18
LMF1-210ENST00000567595 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.66■■■□□ 2.18
LMF1-210ENST00000567595 TIAM1Q13009 1591 aa28.66■■■□□ 2.18
LMF1-210ENST00000567595 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.64■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.62■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.62■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 MAP3K1Q13233 1512 aa28.62■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.61■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.6■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 AFAP1Q8N556 730 aa28.6■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.59■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.59■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.58■■■□□ 2.17
LMF1-210ENST00000567595 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
LMF1-210ENST00000567595 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.57■■■□□ 2.16
LMF1-210ENST00000567595 ATP10AO60312 1499 aa28.57■■■□□ 2.16
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LMF1-210ENST00000567595 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.54■■■□□ 2.16
LMF1-210ENST00000567595 NCOA2Q15596 1464 aa28.53■■■□□ 2.16
LMF1-210ENST00000567595 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.53■■■□□ 2.16
LMF1-210ENST00000567595 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
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LMF1-210ENST00000567595 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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LMF1-210ENST00000567595 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.5■■■□□ 2.15
LMF1-210ENST00000567595 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.46■■■□□ 2.15
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LMF1-210ENST00000567595 MBD5Q9P267 1494 aa28.41■■■□□ 2.14
LMF1-210ENST00000567595 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.4■■■□□ 2.14
LMF1-210ENST00000567595 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
LMF1-210ENST00000567595 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
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LMF1-210ENST00000567595 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
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LMF1-210ENST00000567595 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.32■■■□□ 2.12
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LMF1-210ENST00000567595 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.28■■■□□ 2.12
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LMF1-210ENST00000567595 TSPY10P0CW01 314 aa28.12■■■□□ 2.09
LMF1-210ENST00000567595 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.11■■■□□ 2.09
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LMF1-210ENST00000567595 MROH2AA6NES4 1674 aa28.07■■■□□ 2.08
LMF1-210ENST00000567595 C3P01024 1663 aa28.07■■■□□ 2.08
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LMF1-210ENST00000567595 PREX1Q8TCU6 1659 aa28■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 CROCC2H7BZ55 1655 aa28■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 GGT6Q6P531 493 aa27.99■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.98■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 ZMYM3Q14202 1370 aa27.98■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 DAPK1P53355 1430 aa27.96■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 NPATQ14207 1427 aa27.95■■■□□ 2.07
LMF1-210ENST00000567595 KIF3BO15066 747 aa27.95■■■□□ 2.06
LMF1-210ENST00000567595 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
LMF1-210ENST00000567595 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.92■■■□□ 2.06
LMF1-210ENST00000567595 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.92■■■□□ 2.06
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