RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 PREX2Q70Z35 1606 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.32■■□□□ 1.96
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.29■■□□□ 1.96
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.28■■□□□ 1.96
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.28■■□□□ 1.96
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.27■■□□□ 1.96
CCNDBP1-211ENST00000567434 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.24■■□□□ 1.95
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC1P33527 1531 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM5CP41229 1560 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-211ENST00000567434 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.2■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRMP28827 1452 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIAM1Q13009 1591 aa27.15■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP10AO60312 1499 aa27.14■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFAP1Q8N556 730 aa27.14■■□□□ 1.94
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K1Q13233 1512 aa27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.1■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.1■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 MADDQ8WXG6 1647 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 REREQ9P2R6 1566 aa27.06■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.04■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.04■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCOA2Q15596 1464 aa27.04■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.04■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA6Q8N139 1617 aa27.01■■□□□ 1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGLP35573 1532 aa26.95■■□□□ 1.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO41Q8TF61 875 aa26.95■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP7AQ04656 1500 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 MBD5Q9P267 1494 aa26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 APLP2Q06481 763 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLECQ14165 292 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.88■■□□□ 1.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.85■■□□□ 1.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIA2Q96PC5 1412 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLXNC1O60486 1568 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 A2MP01023 1474 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPA2P54652 639 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-211ENST00000567434 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPY4P0CV99 314 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPY10P0CW01 314 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.67■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 MROH2AA6NES4 1674 aa26.67■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.67■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 C3P01024 1663 aa26.65■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.64■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.6■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 GGT6Q6P531 493 aa26.59■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.58■■□□□ 1.85
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPATQ14207 1427 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZMYM3Q14202 1370 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 CERKQ8TCT0 537 aa26.56■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF3BO15066 747 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms