RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-218	ENST00000566180	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.04	■■■■□ 3.04
RNPS1-218	ENST00000566180	RICTOR	Q6R327	1708 aa		34.03	■■■■□ 3.04
RNPS1-218	ENST00000566180	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.99	■■■■□ 3.03
RNPS1-218	ENST00000566180	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.99	■■■■□ 3.03
RNPS1-218	ENST00000566180	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.97	■■■■□ 3.03
RNPS1-218	ENST00000566180	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.95	■■■■□ 3.03
RNPS1-218	ENST00000566180	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.94	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.94	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.92	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.89	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.89	■■■■□ 3.02
RNPS1-218	ENST00000566180	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	ABCC1	P33527	1531 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.83	■■■■□ 3.01
RNPS1-218	ENST00000566180	KDM5C	P41229	1560 aa		33.81	■■■■□ 3
RNPS1-218	ENST00000566180	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.81	■■■■□ 3
RNPS1-218	ENST00000566180	ATP10A	O60312	1499 aa		33.78	■■■■□ 3
RNPS1-218	ENST00000566180	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.73	■■■□□ 2.99	2e-9	■■■□□ 17.5
RNPS1-218	ENST00000566180	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RNPS1-218	ENST00000566180	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.65	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	PTPRM	P28827	1452 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RNPS1-218	ENST00000566180	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
RNPS1-218	ENST00000566180	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.62	■■■□□ 2.97
RNPS1-218	ENST00000566180	MLEC	Q14165	292 aa		33.61	■■■□□ 2.97
RNPS1-218	ENST00000566180	APLP2	Q06481	763 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RNPS1-218	ENST00000566180	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RNPS1-218	ENST00000566180	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.57	■■■□□ 2.97
RNPS1-218	ENST00000566180	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RNPS1-218	ENST00000566180	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RNPS1-218	ENST00000566180	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RNPS1-218	ENST00000566180	AGL	P35573	1532 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RNPS1-218	ENST00000566180	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RNPS1-218	ENST00000566180	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RNPS1-218	ENST00000566180	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RNPS1-218	ENST00000566180	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.94
RNPS1-218	ENST00000566180	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
RNPS1-218	ENST00000566180	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RNPS1-218	ENST00000566180	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RNPS1-218	ENST00000566180	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RNPS1-218	ENST00000566180	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RNPS1-218	ENST00000566180	A2M	P01023	1474 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RNPS1-218	ENST00000566180	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RNPS1-218	ENST00000566180	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RNPS1-218	ENST00000566180	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RNPS1-218	ENST00000566180	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RNPS1-218	ENST00000566180	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RNPS1-218	ENST00000566180	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RNPS1-218	ENST00000566180	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
RNPS1-218	ENST00000566180	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
RNPS1-218	ENST00000566180	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RNPS1-218	ENST00000566180	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RNPS1-218	ENST00000566180	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RNPS1-218	ENST00000566180	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RNPS1-218	ENST00000566180	GGT6	Q6P531	493 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RNPS1-218	ENST00000566180	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RNPS1-218	ENST00000566180	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RNPS1-218	ENST00000566180	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RNPS1-218	ENST00000566180	KIF3B	O15066	747 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RNPS1-218	ENST00000566180	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
RNPS1-218	ENST00000566180	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RNPS1-218	ENST00000566180	ABCC5	O15440	1437 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNPS1-218	ENST00000566180	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNPS1-218	ENST00000566180	HSPA2	P54652	639 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RNPS1-218	ENST00000566180	C3	P01024	1663 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RNPS1-218	ENST00000566180	DAPK1	P53355	1430 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RNPS1-218	ENST00000566180	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RNPS1-218	ENST00000566180	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNPS1-218	ENST00000566180	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNPS1-218	ENST00000566180	NPAT	Q14207	1427 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RNPS1-218	ENST00000566180	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.97	■■■□□ 2.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms