RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565982.1

TM6SF1-208, Transcript of transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

TSL 3

Gene TM6SF1, Length 856 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1-208ENST00000565982 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.43■■■■■ 4.22
TM6SF1-208ENST00000565982 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
TM6SF1-208ENST00000565982 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.41■■■■■ 4.22
TM6SF1-208ENST00000565982 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.4■■■■■ 4.22
TM6SF1-208ENST00000565982 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
TM6SF1-208ENST00000565982 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.35■■■■■ 4.21
TM6SF1-208ENST00000565982 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.35■■■■■ 4.21
TM6SF1-208ENST00000565982 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
TM6SF1-208ENST00000565982 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
TM6SF1-208ENST00000565982 FANCAO15360 1455 aa41.31■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.31■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.29■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.27■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.26■■■■■ 4.2
TM6SF1-208ENST00000565982 NEO1Q92859 1461 aa41.24■■■■■ 4.19
TM6SF1-208ENST00000565982 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.23■■■■■ 4.19
TM6SF1-208ENST00000565982 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
TM6SF1-208ENST00000565982 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.2■■■■■ 4.19
TM6SF1-208ENST00000565982 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
TM6SF1-208ENST00000565982 AKNAQ7Z591 1439 aa41.18■■■■■ 4.18
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCC1P33527 1531 aa41.11■■■■■ 4.17
TM6SF1-208ENST00000565982 ADGRL1O94910 1474 aa41.1■■■■■ 4.17
TM6SF1-208ENST00000565982 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.08■■■■■ 4.17
TM6SF1-208ENST00000565982 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.17
TM6SF1-208ENST00000565982 MBD5Q9P267 1494 aa41.07■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.05■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.05■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 TSPOAP1O95153 1857 aa41.04■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 DAPK1P53355 1430 aa41.02■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.02■■■■■ 4.16
TM6SF1-208ENST00000565982 TSPY4P0CV99 314 aa41■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 TSPY10P0CW01 314 aa41■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 ITGAEP38570 1179 aa41■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCC5O15440 1437 aa41■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.98■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.96■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.95■■■■■ 4.15
TM6SF1-208ENST00000565982 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.93■■■■■ 4.14
TM6SF1-208ENST00000565982 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.91■■■■■ 4.14
TM6SF1-208ENST00000565982 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.9■■■■■ 4.14
TM6SF1-208ENST00000565982 PTPRKQ15262 1439 aa40.85■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.85■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.85■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 AFAP1Q8N556 730 aa40.85■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 ROCK1Q13464 1354 aa40.85■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.82■■■■■ 4.13
TM6SF1-208ENST00000565982 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.82■■■■■ 4.12
TM6SF1-208ENST00000565982 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.8■■■■■ 4.12
TM6SF1-208ENST00000565982 ADGRL2O95490 1459 aa40.79■■■■■ 4.12
TM6SF1-208ENST00000565982 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.79■■■■■ 4.12
TM6SF1-208ENST00000565982 KDM5CP41229 1560 aa40.77■■■■■ 4.12
TM6SF1-208ENST00000565982 RAPGEF3O95398 923 aa40.76■■■■■ 4.12
TM6SF1-208ENST00000565982 NCOA1Q15788 1441 aa40.73■■■■■ 4.11
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TM6SF1-208ENST00000565982 RICTORQ6R327 1708 aa40.72■■■■■ 4.11
TM6SF1-208ENST00000565982 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.72■■■■■ 4.11
TM6SF1-208ENST00000565982 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.7■■■■■ 4.11
TM6SF1-208ENST00000565982 HFM1A2PYH4 1435 aa40.68■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.67■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 ATP7AQ04656 1500 aa40.67■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.67■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.67■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.65■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 PLXNC1O60486 1568 aa40.65■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.65■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.64■■■■■ 4.1
TM6SF1-208ENST00000565982 KIF15Q9NS87 1388 aa40.61■■■■■ 4.09
TM6SF1-208ENST00000565982 KDM6BO15054 1643 aa40.6■■■■■ 4.09
TM6SF1-208ENST00000565982 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.6■■■■■ 4.09
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TM6SF1-208ENST00000565982 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.55■■■■■ 4.08
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TM6SF1-208ENST00000565982 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.52■■■■■ 4.08
TM6SF1-208ENST00000565982 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.52■■■■■ 4.08
TM6SF1-208ENST00000565982 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.49■■■■■ 4.07
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TM6SF1-208ENST00000565982 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
TM6SF1-208ENST00000565982 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.44■■■■■ 4.06
TM6SF1-208ENST00000565982 A2MP01023 1474 aa40.42■■■■■ 4.06
TM6SF1-208ENST00000565982 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.42■■■■■ 4.06
TM6SF1-208ENST00000565982 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.4■■■■■ 4.06
TM6SF1-208ENST00000565982 ABCA6Q8N139 1617 aa40.4■■■■■ 4.06
TM6SF1-208ENST00000565982 ATP10AO60312 1499 aa40.39■■■■■ 4.06
TM6SF1-208ENST00000565982 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.37■■■■■ 4.05
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TM6SF1-208ENST00000565982 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
TM6SF1-208ENST00000565982 KIF3BO15066 747 aa40.22■■■■■ 4.03
TM6SF1-208ENST00000565982 AGLP35573 1532 aa40.21■■■■■ 4.03
TM6SF1-208ENST00000565982 TRIM52Q96A61 297 aa40.19■■■■■ 4.02
TM6SF1-208ENST00000565982 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.18■■■■■ 4.02
TM6SF1-208ENST00000565982 UNC13BO14795 1591 aa40.13■■■■■ 4.01
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