RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
C15orf40-211ENST00000565712 RICTORQ6R327 1708 aa23.32■■□□□ 1.32
C15orf40-211ENST00000565712 PREX2Q70Z35 1606 aa23.3■■□□□ 1.32
C15orf40-211ENST00000565712 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.3■■□□□ 1.32
C15orf40-211ENST00000565712 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.29■■□□□ 1.32
C15orf40-211ENST00000565712 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
C15orf40-211ENST00000565712 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.27■■□□□ 1.32
C15orf40-211ENST00000565712 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.26■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.25■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.25■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.23■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 TIAM1Q13009 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.23■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.22■■□□□ 1.31
C15orf40-211ENST00000565712 ABCC1P33527 1531 aa23.2■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 AFAP1Q8N556 730 aa23.19■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 MAP3K1Q13233 1512 aa23.18■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.17■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 KDM5CP41229 1560 aa23.16■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.16■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.15■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.14■■□□□ 1.3
C15orf40-211ENST00000565712 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.14■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.14■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 NCOA2Q15596 1464 aa23.13■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.13■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 APLP2Q06481 763 aa23.13■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.13■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.12■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 ATP10AO60312 1499 aa23.11■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.11■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.1■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.1■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.08■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C15orf40-211ENST00000565712 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.08■■□□□ 1.28
C15orf40-211ENST00000565712 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.06■■□□□ 1.28
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
C15orf40-211ENST00000565712 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
C15orf40-211ENST00000565712 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.02■■□□□ 1.28
C15orf40-211ENST00000565712 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.01■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 ABCA6Q8N139 1617 aa23■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.99■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 REREQ9P2R6 1566 aa22.99■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 MBD5Q9P267 1494 aa22.98■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 MADDQ8WXG6 1647 aa22.98■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 MLECQ14165 292 aa22.98■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.98■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 PTPRMP28827 1452 aa22.97■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.96■■□□□ 1.27
C15orf40-211ENST00000565712 ATP7AQ04656 1500 aa22.95■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.95■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 MIA2Q96PC5 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 AGLP35573 1532 aa22.92■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.92■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
C15orf40-211ENST00000565712 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.88■■□□□ 1.25
C15orf40-211ENST00000565712 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.88■■□□□ 1.25
C15orf40-211ENST00000565712 A2MP01023 1474 aa22.86■■□□□ 1.25
C15orf40-211ENST00000565712 TSPY4P0CV99 314 aa22.86■■□□□ 1.25
C15orf40-211ENST00000565712 TSPY10P0CW01 314 aa22.86■■□□□ 1.25
C15orf40-211ENST00000565712 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.83■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 PLXNC1O60486 1568 aa22.82■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.8■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.79■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.79■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
C15orf40-211ENST00000565712 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.76■■□□□ 1.23
C15orf40-211ENST00000565712 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.75■■□□□ 1.23
C15orf40-211ENST00000565712 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
C15orf40-211ENST00000565712 GGT6Q6P531 493 aa22.73■■□□□ 1.23
C15orf40-211ENST00000565712 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
C15orf40-211ENST00000565712 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.72■■□□□ 1.23
C15orf40-211ENST00000565712 ABCC5O15440 1437 aa22.7■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.69■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 KIF3BO15066 747 aa22.69■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 DAPK1P53355 1430 aa22.68■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.67■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 C3P01024 1663 aa22.66■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 ZMYM3Q14202 1370 aa22.65■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 MROH2AA6NES4 1674 aa22.65■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.65■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
C15orf40-211ENST00000565712 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.62■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.61■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 KIF15Q9NS87 1388 aa22.61■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.6■■□□□ 1.21
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