RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564323.5

ZFP90-204, Transcript of ZFP90 zinc finger protein, human

TSL 4 BASIC

Gene ZFP90, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZFP90-204	ENST00000564323	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.39	■■■■■ 4.54
ZFP90-204	ENST00000564323	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.37	■■■■■ 4.53
ZFP90-204	ENST00000564323	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.36	■■■■■ 4.53
ZFP90-204	ENST00000564323	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.35	■■■■■ 4.53
ZFP90-204	ENST00000564323	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.32	■■■■■ 4.53
ZFP90-204	ENST00000564323	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.32	■■■■■ 4.52
ZFP90-204	ENST00000564323	PTPRM	P28827	1452 aa		43.28	■■■■■ 4.52
ZFP90-204	ENST00000564323	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.27	■■■■■ 4.52
ZFP90-204	ENST00000564323	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.26	■■■■■ 4.52
ZFP90-204	ENST00000564323	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.24	■■■■■ 4.51
ZFP90-204	ENST00000564323	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.19	■■■■■ 4.5
ZFP90-204	ENST00000564323	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.19	■■■■■ 4.5
ZFP90-204	ENST00000564323	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.17	■■■■■ 4.5
ZFP90-204	ENST00000564323	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.15	■■■■■ 4.5
ZFP90-204	ENST00000564323	ATP10A	O60312	1499 aa		43.15	■■■■■ 4.5
ZFP90-204	ENST00000564323	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.14	■■■■■ 4.5
ZFP90-204	ENST00000564323	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.12	■■■■■ 4.49
ZFP90-204	ENST00000564323	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.12	■■■■■ 4.49
ZFP90-204	ENST00000564323	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.11	■■■■■ 4.49
ZFP90-204	ENST00000564323	MLEC	Q14165	292 aa		43.1	■■■■■ 4.49
ZFP90-204	ENST00000564323	KDM5C	P41229	1560 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ZFP90-204	ENST00000564323	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.08	■■■■■ 4.49
ZFP90-204	ENST00000564323	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	ABCC1	P33527	1531 aa		43.03	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.03	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.02	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.01	■■■■■ 4.48
ZFP90-204	ENST00000564323	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43	■■■■■ 4.47
ZFP90-204	ENST00000564323	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
ZFP90-204	ENST00000564323	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.94	■■■■■ 4.46
ZFP90-204	ENST00000564323	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
ZFP90-204	ENST00000564323	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.92	■■■■■ 4.46
ZFP90-204	ENST00000564323	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.9	■■■■■ 4.46
ZFP90-204	ENST00000564323	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ZFP90-204	ENST00000564323	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.89	■■■■■ 4.46
ZFP90-204	ENST00000564323	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.88	■■■■■ 4.45
ZFP90-204	ENST00000564323	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.83	■■■■■ 4.45
ZFP90-204	ENST00000564323	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.82	■■■■■ 4.45
ZFP90-204	ENST00000564323	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ZFP90-204	ENST00000564323	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ZFP90-204	ENST00000564323	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ZFP90-204	ENST00000564323	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ZFP90-204	ENST00000564323	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
ZFP90-204	ENST00000564323	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
ZFP90-204	ENST00000564323	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	AGL	P35573	1532 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ZFP90-204	ENST00000564323	HSPA2	P54652	639 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ZFP90-204	ENST00000564323	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ZFP90-204	ENST00000564323	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ZFP90-204	ENST00000564323	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
ZFP90-204	ENST00000564323	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ZFP90-204	ENST00000564323	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
ZFP90-204	ENST00000564323	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
ZFP90-204	ENST00000564323	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.52	■■■■■ 4.4
ZFP90-204	ENST00000564323	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
ZFP90-204	ENST00000564323	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
ZFP90-204	ENST00000564323	A2M	P01023	1474 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ZFP90-204	ENST00000564323	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ZFP90-204	ENST00000564323	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ZFP90-204	ENST00000564323	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ZFP90-204	ENST00000564323	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ZFP90-204	ENST00000564323	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.41	■■■■■ 4.38
ZFP90-204	ENST00000564323	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.39	■■■■■ 4.38
ZFP90-204	ENST00000564323	C3	P01024	1663 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ZFP90-204	ENST00000564323	GGT6	Q6P531	493 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ZFP90-204	ENST00000564323	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ZFP90-204	ENST00000564323	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ZFP90-204	ENST00000564323	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ZFP90-204	ENST00000564323	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.34	■■■■■ 4.37
ZFP90-204	ENST00000564323	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
ZFP90-204	ENST00000564323	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
ZFP90-204	ENST00000564323	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ZFP90-204	ENST00000564323	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ZFP90-204	ENST00000564323	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ZFP90-204	ENST00000564323	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ZFP90-204	ENST00000564323	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ZFP90-204	ENST00000564323	NPAT	Q14207	1427 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ZFP90-204	ENST00000564323	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ZFP90-204	ENST00000564323	APLP2	Q06481	763 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ZFP90-204	ENST00000564323	KIF3B	O15066	747 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ZFP90-204	ENST00000564323	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ZFP90-204	ENST00000564323	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ZFP90-204	ENST00000564323	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ZFP90-204	ENST00000564323	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.34
ZFP90-204	ENST00000564323	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.11	■■■■■ 4.33
ZFP90-204	ENST00000564323	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.1	■■■■■ 4.33
ZFP90-204	ENST00000564323	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ZFP90-204	ENST00000564323	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.98	■■■■■ 4.31
ZFP90-204	ENST00000564323	CERK	Q8TCT0	537 aa		41.98	■■■■■ 4.31
ZFP90-204	ENST00000564323	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.97	■■■■■ 4.31
ZFP90-204	ENST00000564323	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.96	■■■■■ 4.31
ZFP90-204	ENST00000564323	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
ZFP90-204	ENST00000564323	PTPRT	O14522	1441 aa		41.94	■■■■■ 4.3

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