RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563901.5

SH3GL3-205, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SH3GL3, Length 1,647 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3-205ENST00000563901 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.63■■■■■ 4.25
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SH3GL3-205ENST00000563901 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.55■■■■■ 4.24
SH3GL3-205ENST00000563901 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.52■■■■■ 4.24
SH3GL3-205ENST00000563901 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.51■■■■■ 4.24
SH3GL3-205ENST00000563901 FANCAO15360 1455 aa41.51■■■■■ 4.24
SH3GL3-205ENST00000563901 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
SH3GL3-205ENST00000563901 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
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SH3GL3-205ENST00000563901 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.44■■■■■ 4.22
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SH3GL3-205ENST00000563901 AKNAQ7Z591 1439 aa41.36■■■■■ 4.21
SH3GL3-205ENST00000563901 NEO1Q92859 1461 aa41.35■■■■■ 4.21
SH3GL3-205ENST00000563901 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
SH3GL3-205ENST00000563901 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.32■■■■■ 4.21
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SH3GL3-205ENST00000563901 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.15■■■■■ 4.18
SH3GL3-205ENST00000563901 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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SH3GL3-205ENST00000563901 DAPK1P53355 1430 aa41.12■■■■■ 4.17
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SH3GL3-205ENST00000563901 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.11■■■■■ 4.17
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SH3GL3-205ENST00000563901 AFAP1Q8N556 730 aa41.1■■■■■ 4.17
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SH3GL3-205ENST00000563901 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.96■■■■■ 4.15
SH3GL3-205ENST00000563901 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.95■■■■■ 4.15
SH3GL3-205ENST00000563901 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.94■■■■■ 4.15
SH3GL3-205ENST00000563901 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.94■■■■■ 4.14
SH3GL3-205ENST00000563901 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
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SH3GL3-205ENST00000563901 TSPY10P0CW01 314 aa40.91■■■■■ 4.14
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