RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560937.1

MFGE8-214, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-214ENST00000560937 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.07■■■□□ 2.08
MFGE8-214ENST00000560937 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
MFGE8-214ENST00000560937 FANCAO15360 1455 aa28.04■■■□□ 2.08
MFGE8-214ENST00000560937 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.01■■■□□ 2.08
MFGE8-214ENST00000560937 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.01■■■□□ 2.07
MFGE8-214ENST00000560937 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
MFGE8-214ENST00000560937 NEO1Q92859 1461 aa27.98■■■□□ 2.07
MFGE8-214ENST00000560937 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-214ENST00000560937 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-214ENST00000560937 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
MFGE8-214ENST00000560937 AKNAQ7Z591 1439 aa27.93■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.93■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 ADGRL1O94910 1474 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 ABCC1P33527 1531 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 MIA2Q96PC5 1412 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 KDM6BO15054 1643 aa27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-214ENST00000560937 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.87■■■□□ 2.05
MFGE8-214ENST00000560937 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
MFGE8-214ENST00000560937 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
MFGE8-214ENST00000560937 RICTORQ6R327 1708 aa27.84■■■□□ 2.05
MFGE8-214ENST00000560937 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.84■■■□□ 2.05
MFGE8-214ENST00000560937 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.79■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.76■■■□□ 2.04
MFGE8-214ENST00000560937 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.74■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.74■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.73■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 RAPGEF3O95398 923 aa27.72■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.71■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 MBD5Q9P267 1494 aa27.71■■■□□ 2.03
MFGE8-214ENST00000560937 KDM5CP41229 1560 aa27.69■■■□□ 2.02
MFGE8-214ENST00000560937 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.68■■■□□ 2.02
MFGE8-214ENST00000560937 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.67■■■□□ 2.02
MFGE8-214ENST00000560937 AFAP1Q8N556 730 aa27.66■■■□□ 2.02
MFGE8-214ENST00000560937 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.65■■■□□ 2.02
MFGE8-214ENST00000560937 DAPK1P53355 1430 aa27.64■■■□□ 2.02
MFGE8-214ENST00000560937 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.016e-6■□□□□ 9.1
MFGE8-214ENST00000560937 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.62■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.61■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.61■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 ATP7AQ04656 1500 aa27.61■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 ABCC5O15440 1437 aa27.6■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.59■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 ITGAEP38570 1179 aa27.59■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.59■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 TSPY4P0CV99 314 aa27.58■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 TSPY10P0CW01 314 aa27.58■■■□□ 2.01
MFGE8-214ENST00000560937 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.57■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.57■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.57■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 ABCA6Q8N139 1617 aa27.56■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.56■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.55■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.52■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.52■■■□□ 2
MFGE8-214ENST00000560937 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.51■■□□□ 1.99
MFGE8-214ENST00000560937 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.51■■□□□ 1.99
MFGE8-214ENST00000560937 PLXNC1O60486 1568 aa27.51■■□□□ 1.99
MFGE8-214ENST00000560937 PTPRKQ15262 1439 aa27.48■■□□□ 1.99
MFGE8-214ENST00000560937 ADGRL2O95490 1459 aa27.44■■□□□ 1.98
MFGE8-214ENST00000560937 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.44■■□□□ 1.98
MFGE8-214ENST00000560937 ATP10AO60312 1499 aa27.43■■□□□ 1.98
MFGE8-214ENST00000560937 KIF15Q9NS87 1388 aa27.38■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.38■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 NCOA1Q15788 1441 aa27.38■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 REREQ9P2R6 1566 aa27.38■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.38■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 A2MP01023 1474 aa27.38■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 ROCK1Q13464 1354 aa27.37■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.37■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.36■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
MFGE8-214ENST00000560937 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
MFGE8-214ENST00000560937 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-214ENST00000560937 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-214ENST00000560937 ERBINQ96RT1 1412 aa27.27■■□□□ 1.96
MFGE8-214ENST00000560937 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.27■■□□□ 1.96
MFGE8-214ENST00000560937 AGLP35573 1532 aa27.26■■□□□ 1.96
MFGE8-214ENST00000560937 HFM1A2PYH4 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
MFGE8-214ENST00000560937 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.24■■□□□ 1.95
MFGE8-214ENST00000560937 NAIPQ13075 1403 aa27.24■■□□□ 1.95
MFGE8-214ENST00000560937 KIF3BO15066 747 aa27.21■■□□□ 1.95
MFGE8-214ENST00000560937 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
MFGE8-214ENST00000560937 MLECQ14165 292 aa27.18■■□□□ 1.94
MFGE8-214ENST00000560937 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.17■■□□□ 1.94
MFGE8-214ENST00000560937 DEPDC5O75140 1603 aa27.16■■□□□ 1.94
MFGE8-214ENST00000560937 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms