RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-204ENST00000558666 MICALL2Q8IY33 904 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-204ENST00000558666 G3V3G9 751 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-204ENST00000558666 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
TMOD3-204ENST00000558666 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD3-204ENST00000558666 WIZO95785 1651 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R37O75864 691 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-204ENST00000558666 SMARCA2P51531 1590 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 HMGXB3Q12766 1538 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 KIF3CO14782 793 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-204ENST00000558666 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 PRDM2Q13029 1718 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf72A6NCS6 295 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 SNPHO15079 494 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 TMC2Q8TDI7 906 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 NESP48681 1621 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 NCAPD3P42695 1498 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-204ENST00000558666 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 CFAP44Q96MT7 982 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 ST18O60284 1047 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 DOK7Q18PE1 504 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 ERCC6Q03468 1493 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 FOXK1P85037 733 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 DSG2Q14126 1118 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 RIMBP2O15034 1052 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 MFSD10Q14728 455 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-204ENST00000558666 PDE4AP27815 886 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 PLPP6Q8IY26 295 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 POTEMA6NI47 508 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 SLC34A2O95436 690 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 POTEGQ6S5H5 508 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 PLCB2Q00722 1185 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 MARVELD3Q96A59 401 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 GPR153Q6NV75 609 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 EMP3P54852 163 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-204ENST00000558666 ARSIQ5FYB1 569 aa7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 SLC24A1O60721 1099 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 OXER1Q8TDS5 423 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 NUDT7P0C024 238 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 CAMK2BQ13554 666 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 FAM205CA6NFA0 338 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-204ENST00000558666 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 ERBB3P21860 1342 aa7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 POTEB3A0JP26 581 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 POTEBQ6S5H4 581 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 CUX2O14529 1486 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 WDR62O43379 1518 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D12O60347 775 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 LHX6Q9UPM6 363 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 CFTRP13569 1480 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 E2F4Q16254 413 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 WDR70Q9NW82 654 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.72□□□□□ -1.17
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