RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FANCAO15360 1455 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEO1Q92859 1461 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KDM6BO15054 1643 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AKNAQ7Z591 1439 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGRL1O94910 1474 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RAPGEF3O95398 923 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.82□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCC1P33527 1531 aa10.82□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MIA2Q96PC5 1412 aa10.82□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RICTORQ6R327 1708 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POTEDQ86YR6 584 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AFAP1Q8N556 730 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.78□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.78□□□□□ -0.68
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.77□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MBD5Q9P267 1494 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KDM5CP41229 1560 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSPY4P0CV99 314 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSPY10P0CW01 314 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ITGAEP38570 1179 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP7AQ04656 1500 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DAPK1P53355 1430 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD1P1-202ENST00000558550 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCC5O15440 1437 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCA6Q8N139 1617 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP10AO60312 1499 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLXNC1O60486 1568 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A2MP01023 1474 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPRKQ15262 1439 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 REREQ9P2R6 1566 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MLECQ14165 292 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NCOA1Q15788 1441 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF15Q9NS87 1388 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGRL2O95490 1459 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF3BO15066 747 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ROCK1Q13464 1354 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BCORL1Q5H9F3 1711 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AGLP35573 1532 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GGT6Q6P531 493 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERBINQ96RT1 1412 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms