RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557944.1

MFGE8-204, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 435 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-204ENST00000557944 PREX2Q70Z35 1606 aa30.51■■■□□ 2.48
MFGE8-204ENST00000557944 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.5■■■□□ 2.47
MFGE8-204ENST00000557944 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
MFGE8-204ENST00000557944 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.48■■■□□ 2.47
MFGE8-204ENST00000557944 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.47■■■□□ 2.47
MFGE8-204ENST00000557944 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.46■■■□□ 2.47
MFGE8-204ENST00000557944 AKNAQ7Z591 1439 aa30.44■■■□□ 2.46
MFGE8-204ENST00000557944 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.42■■■□□ 2.46
MFGE8-204ENST00000557944 MIA2Q96PC5 1412 aa30.42■■■□□ 2.46
MFGE8-204ENST00000557944 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
MFGE8-204ENST00000557944 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.38■■■□□ 2.45
MFGE8-204ENST00000557944 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
MFGE8-204ENST00000557944 ADGRL1O94910 1474 aa30.38■■■□□ 2.45
MFGE8-204ENST00000557944 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.33■■■□□ 2.45
MFGE8-204ENST00000557944 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.33■■■□□ 2.45
MFGE8-204ENST00000557944 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.33■■■□□ 2.45
MFGE8-204ENST00000557944 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 KDM6BO15054 1643 aa30.31■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.31■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 ABCC1P33527 1531 aa30.31■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.28■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
MFGE8-204ENST00000557944 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.25■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.24■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.23■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 RAPGEF3O95398 923 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
MFGE8-204ENST00000557944 MBD5Q9P267 1494 aa30.19■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.18■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.428e-16■□□□□ 8.9
MFGE8-204ENST00000557944 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 AFAP1Q8N556 730 aa30.15■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 RICTORQ6R327 1708 aa30.15■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.15■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.15■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
MFGE8-204ENST00000557944 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.13■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.13■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 KDM5CP41229 1560 aa30.12■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.12■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.08■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 TSPY4P0CV99 314 aa30.08■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 TSPY10P0CW01 314 aa30.08■■■□□ 2.41
MFGE8-204ENST00000557944 ABCC5O15440 1437 aa30.04■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.03■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.03■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.03■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 DAPK1P53355 1430 aa30.03■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.01■■■□□ 2.4
MFGE8-204ENST00000557944 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.01■■■□□ 2.39
MFGE8-204ENST00000557944 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.98■■■□□ 2.39
MFGE8-204ENST00000557944 ATP7AQ04656 1500 aa29.97■■■□□ 2.39
MFGE8-204ENST00000557944 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
MFGE8-204ENST00000557944 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.97■■■□□ 2.39
MFGE8-204ENST00000557944 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.96■■■□□ 2.39
MFGE8-204ENST00000557944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.95■■■□□ 2.38
MFGE8-204ENST00000557944 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.92■■■□□ 2.38
MFGE8-204ENST00000557944 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.92■■■□□ 2.38
MFGE8-204ENST00000557944 ATP10AO60312 1499 aa29.92■■■□□ 2.38
MFGE8-204ENST00000557944 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.89■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.88■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 ITGAEP38570 1179 aa29.87■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 ADGRL2O95490 1459 aa29.86■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 ABCA6Q8N139 1617 aa29.85■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 PTPRKQ15262 1439 aa29.85■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 PLXNC1O60486 1568 aa29.85■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.84■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 ROCK1Q13464 1354 aa29.84■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 REREQ9P2R6 1566 aa29.84■■■□□ 2.37
MFGE8-204ENST00000557944 NCOA1Q15788 1441 aa29.82■■■□□ 2.36
MFGE8-204ENST00000557944 A2MP01023 1474 aa29.81■■■□□ 2.36
MFGE8-204ENST00000557944 KIF15Q9NS87 1388 aa29.8■■■□□ 2.36
MFGE8-204ENST00000557944 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
MFGE8-204ENST00000557944 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.79■■■□□ 2.36
MFGE8-204ENST00000557944 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.77■■■□□ 2.36
MFGE8-204ENST00000557944 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.76■■■□□ 2.35
MFGE8-204ENST00000557944 AGLP35573 1532 aa29.75■■■□□ 2.35
MFGE8-204ENST00000557944 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MFGE8-204ENST00000557944 ERBINQ96RT1 1412 aa29.71■■■□□ 2.35
MFGE8-204ENST00000557944 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
MFGE8-204ENST00000557944 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.65■■■□□ 2.34
MFGE8-204ENST00000557944 HFM1A2PYH4 1435 aa29.64■■■□□ 2.34
MFGE8-204ENST00000557944 KIF3BO15066 747 aa29.63■■■□□ 2.33
MFGE8-204ENST00000557944 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
MFGE8-204ENST00000557944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.6■■■□□ 2.33
MFGE8-204ENST00000557944 NAIPQ13075 1403 aa29.6■■■□□ 2.33
MFGE8-204ENST00000557944 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.59■■■□□ 2.33
MFGE8-204ENST00000557944 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.58■■■□□ 2.33
MFGE8-204ENST00000557944 MLECQ14165 292 aa29.55■■■□□ 2.32
MFGE8-204ENST00000557944 GGT6Q6P531 493 aa29.54■■■□□ 2.32
MFGE8-204ENST00000557944 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.53■■■□□ 2.32
MFGE8-204ENST00000557944 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MFGE8-204ENST00000557944 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms