RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557620.2

TPRX1P1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TPRX1P1, Length 319 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1P1-201ENST00000557620 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.86□□□□□ -0.83
TPRX1P1-201ENST00000557620 KIF14Q15058 1648 aa9.85□□□□□ -0.83
TPRX1P1-201ENST00000557620 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
TPRX1P1-201ENST00000557620 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.84□□□□□ -0.83
TPRX1P1-201ENST00000557620 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TPRX1P1-201ENST00000557620 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.83□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.82□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.82□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 RAPGEF3O95398 923 aa9.81□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 AFAP1Q8N556 730 aa9.81□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 AKNAQ7Z591 1439 aa9.81□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.8□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 FANCAO15360 1455 aa9.8□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 ITGAEP38570 1179 aa9.8□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 MIA2Q96PC5 1412 aa9.8□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.8□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 ARHGAP5Q13017 1502 aa9.79□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.79□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.79□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.79□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 PTPRMP28827 1452 aa9.79□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 MADDQ8WXG6 1647 aa9.78□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.77□□□□□ -0.84
TPRX1P1-201ENST00000557620 TSPY4P0CV99 314 aa9.77□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 TSPY10P0CW01 314 aa9.77□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 NEO1Q92859 1461 aa9.77□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.76□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.75□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 MBD5Q9P267 1494 aa9.75□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.74□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.74□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.73□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.73□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.73□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 ABCC5O15440 1437 aa9.73□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.72□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 PREX2Q70Z35 1606 aa9.72□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 FBXO41Q8TF61 875 aa9.72□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.72□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 PTPRKQ15262 1439 aa9.72□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.71□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.71□□□□□ -0.85
TPRX1P1-201ENST00000557620 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.71□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 DAPK1P53355 1430 aa9.69□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.69□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.69□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.69□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.68□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 ABCC1P33527 1531 aa9.68□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.68□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 HSPA2P54652 639 aa9.68□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 RICTORQ6R327 1708 aa9.68□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.67□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.67□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.66□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.66□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.66□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.65□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 NCOA1Q15788 1441 aa9.65□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.65□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.65□□□□□ -0.86
TPRX1P1-201ENST00000557620 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.64□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.64□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 ROCK1Q13464 1354 aa9.63□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.63□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.63□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 KIF15Q9NS87 1388 aa9.63□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 KIF3BO15066 747 aa9.62□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 ATP10AO60312 1499 aa9.61□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 KDM5CP41229 1560 aa9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 NAIPQ13075 1403 aa9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 MLECQ14165 292 aa9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 GGT6Q6P531 493 aa9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 ATP7AQ04656 1500 aa9.59□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.59□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 ADGRL2O95490 1459 aa9.59□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 A2MP01023 1474 aa9.59□□□□□ -0.87
TPRX1P1-201ENST00000557620 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.58□□□□□ -0.88
TPRX1P1-201ENST00000557620 HRCP23327 699 aa9.58□□□□□ -0.88
TPRX1P1-201ENST00000557620 TRIM52Q96A61 297 aa9.58□□□□□ -0.88
TPRX1P1-201ENST00000557620 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.58□□□□□ -0.88
TPRX1P1-201ENST00000557620 HFM1A2PYH4 1435 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms