RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557485.5

WDR20-213, Transcript of WD repeat domain 20, humanhuman

TSL 3

Gene WDR20, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR20-213ENST00000557485 AKNAQ7Z591 1439 aa29.88■■■□□ 2.37
WDR20-213ENST00000557485 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
WDR20-213ENST00000557485 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
WDR20-213ENST00000557485 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.87■■■□□ 2.37
WDR20-213ENST00000557485 PREX2Q70Z35 1606 aa29.86■■■□□ 2.37
WDR20-213ENST00000557485 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
WDR20-213ENST00000557485 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.82■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.8■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.79■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.79■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 ADGRL1O94910 1474 aa29.79■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 KDM6BO15054 1643 aa29.78■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.77■■■□□ 2.36
WDR20-213ENST00000557485 RAPGEF3O95398 923 aa29.76■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.72■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.72■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.71■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 ABCC1P33527 1531 aa29.71■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 MIA2Q96PC5 1412 aa29.71■■■□□ 2.35
WDR20-213ENST00000557485 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.347e-8■■■■□ 26.6
WDR20-213ENST00000557485 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.68■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.67■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.67■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.67■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.66■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.66■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 AFAP1Q8N556 730 aa29.65■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.65■■■□□ 2.34
WDR20-213ENST00000557485 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.64■■■□□ 2.33
WDR20-213ENST00000557485 MBD5Q9P267 1494 aa29.61■■■□□ 2.33
WDR20-213ENST00000557485 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.6■■■□□ 2.33
WDR20-213ENST00000557485 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
WDR20-213ENST00000557485 RICTORQ6R327 1708 aa29.55■■■□□ 2.32
WDR20-213ENST00000557485 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.55■■■□□ 2.32
WDR20-213ENST00000557485 KDM5CP41229 1560 aa29.52■■■□□ 2.32
WDR20-213ENST00000557485 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.52■■■□□ 2.32
WDR20-213ENST00000557485 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
WDR20-213ENST00000557485 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.5■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.49■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.48■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.47■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.47■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.46■■■□□ 2.31
WDR20-213ENST00000557485 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 ABCC5O15440 1437 aa29.44■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.43■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 TSPY4P0CV99 314 aa29.41■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 TSPY10P0CW01 314 aa29.41■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.41■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 DAPK1P53355 1430 aa29.4■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.4■■■□□ 2.3
WDR20-213ENST00000557485 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.296e-7■■□□□ 11.9
WDR20-213ENST00000557485 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.37■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 ATP7AQ04656 1500 aa29.36■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.36■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 ATP10AO60312 1499 aa29.34■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.33■■■□□ 2.29
WDR20-213ENST00000557485 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.32■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.32■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.31■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 ABCA6Q8N139 1617 aa29.31■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 PTPRKQ15262 1439 aa29.3■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 ITGAEP38570 1179 aa29.3■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.3■■■□□ 2.28
WDR20-213ENST00000557485 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
WDR20-213ENST00000557485 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.23■■■□□ 2.27
WDR20-213ENST00000557485 A2MP01023 1474 aa29.23■■■□□ 2.27
WDR20-213ENST00000557485 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.21■■■□□ 2.27
WDR20-213ENST00000557485 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.2■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 REREQ9P2R6 1566 aa29.2■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 NCOA1Q15788 1441 aa29.2■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 ADGRL2O95490 1459 aa29.19■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 KIF15Q9NS87 1388 aa29.19■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 PLXNC1O60486 1568 aa29.17■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.17■■■□□ 2.26
WDR20-213ENST00000557485 ROCK1Q13464 1354 aa29.13■■■□□ 2.25
WDR20-213ENST00000557485 AGLP35573 1532 aa29.13■■■□□ 2.25
WDR20-213ENST00000557485 MLECQ14165 292 aa29.12■■■□□ 2.25
WDR20-213ENST00000557485 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.11■■■□□ 2.25
WDR20-213ENST00000557485 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.1■■■□□ 2.25
WDR20-213ENST00000557485 KIF3BO15066 747 aa29.07■■■□□ 2.24
WDR20-213ENST00000557485 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.06■■■□□ 2.24
WDR20-213ENST00000557485 ERBINQ96RT1 1412 aa29.04■■■□□ 2.24
WDR20-213ENST00000557485 GGT6Q6P531 493 aa29.02■■■□□ 2.24
WDR20-213ENST00000557485 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.02■■■□□ 2.24
WDR20-213ENST00000557485 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29■■■□□ 2.23
WDR20-213ENST00000557485 NAIPQ13075 1403 aa28.97■■■□□ 2.23
WDR20-213ENST00000557485 HFM1A2PYH4 1435 aa28.95■■■□□ 2.23
WDR20-213ENST00000557485 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
WDR20-213ENST00000557485 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.93■■■□□ 2.22
WDR20-213ENST00000557485 MADDQ8WXG6 1647 aa28.9■■■□□ 2.22
WDR20-213ENST00000557485 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
WDR20-213ENST00000557485 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms