RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 RICTORQ6R327 1708 aa28.01■■■□□ 2.07
NEDD1-212ENST00000557478 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.99■■■□□ 2.07
NEDD1-212ENST00000557478 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.98■■■□□ 2.07
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.98■■■□□ 2.07
NEDD1-212ENST00000557478 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.96■■■□□ 2.07
NEDD1-212ENST00000557478 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.93■■■□□ 2.06
NEDD1-212ENST00000557478 PREX2Q70Z35 1606 aa27.89■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 ATP10AO60312 1499 aa27.86■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.85■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.84■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 KDM5CP41229 1560 aa27.84■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.84■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.84■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 AFAP1Q8N556 730 aa27.83■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.83■■■□□ 2.05
NEDD1-212ENST00000557478 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.83■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.82■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.82■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.81■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 PTPRMP28827 1452 aa27.81■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 ABCC1P33527 1531 aa27.8■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.79■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.79■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.79■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.76■■■□□ 2.04
NEDD1-212ENST00000557478 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.75■■■□□ 2.03
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
NEDD1-212ENST00000557478 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.75■■■□□ 2.03
NEDD1-212ENST00000557478 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.72■■■□□ 2.03
NEDD1-212ENST00000557478 REREQ9P2R6 1566 aa27.71■■■□□ 2.03
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.7■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 MADDQ8WXG6 1647 aa27.7■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.68■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.65■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 MLECQ14165 292 aa27.65■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 MAP3K1Q13233 1512 aa27.65■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.64■■■□□ 2.02
NEDD1-212ENST00000557478 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.64■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 AGLP35573 1532 aa27.63■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.62■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 TIAM1Q13009 1591 aa27.62■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 NCOA2Q15596 1464 aa27.59■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 APLP2Q06481 763 aa27.58■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
NEDD1-212ENST00000557478 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.57■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 ABCA6Q8N139 1617 aa27.56■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.55■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.54■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.53■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.53■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 ATP7AQ04656 1500 aa27.52■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.52■■■□□ 2
NEDD1-212ENST00000557478 MBD5Q9P267 1494 aa27.51■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.48■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 A2MP01023 1474 aa27.46■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.46■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.45■■□□□ 1.99
NEDD1-212ENST00000557478 TSPY4P0CV99 314 aa27.45■■□□□ 1.98
NEDD1-212ENST00000557478 TSPY10P0CW01 314 aa27.45■■□□□ 1.98
NEDD1-212ENST00000557478 MIA2Q96PC5 1412 aa27.44■■□□□ 1.98
NEDD1-212ENST00000557478 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.44■■□□□ 1.98
NEDD1-212ENST00000557478 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.42■■□□□ 1.98
NEDD1-212ENST00000557478 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
NEDD1-212ENST00000557478 PLXNC1O60486 1568 aa27.39■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.38■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.37■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.36■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.35■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NEDD1-212ENST00000557478 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 NPATQ14207 1427 aa27.32■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 GGT6Q6P531 493 aa27.31■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 ZMYM3Q14202 1370 aa27.3■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.3■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 MROH2AA6NES4 1674 aa27.28■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.28■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.27■■□□□ 1.96
NEDD1-212ENST00000557478 HSPA2P54652 639 aa27.26■■□□□ 1.95
NEDD1-212ENST00000557478 C3P01024 1663 aa27.24■■□□□ 1.95
NEDD1-212ENST00000557478 KIF3BO15066 747 aa27.23■■□□□ 1.95
NEDD1-212ENST00000557478 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.22■■□□□ 1.95
NEDD1-212ENST00000557478 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.16■■□□□ 1.94
NEDD1-212ENST00000557478 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.16■■□□□ 1.94
NEDD1-212ENST00000557478 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.15■■□□□ 1.94
NEDD1-212ENST00000557478 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NEDD1-212ENST00000557478 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.12■■□□□ 1.93
NEDD1-212ENST00000557478 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NEDD1-212ENST00000557478 PTPRKQ15262 1439 aa27.12■■□□□ 1.93
NEDD1-212ENST00000557478 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.11■■□□□ 1.93
NEDD1-212ENST00000557478 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms