RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557389.1

NFKBIA-209, Transcript of NFKB inhibitor alpha, human

TSL 2 BASIC

Gene NFKBIA, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKBIA-209	ENST00000557389	GLI2	P10070	1586 aa		42.9	■■■■■ 4.46
NFKBIA-209	ENST00000557389	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.88	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	PLCH2	O75038	1416 aa		42.86	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.86	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.85	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.83	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.82	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.82	■■■■■ 4.45
NFKBIA-209	ENST00000557389	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
NFKBIA-209	ENST00000557389	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.8	■■■■■ 4.44
NFKBIA-209	ENST00000557389	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.79	■■■■■ 4.44
NFKBIA-209	ENST00000557389	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.75	■■■■■ 4.43
NFKBIA-209	ENST00000557389	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.72	■■■■■ 4.43
NFKBIA-209	ENST00000557389	ITGAE	P38570	1179 aa		42.72	■■■■■ 4.43
NFKBIA-209	ENST00000557389	FANCA	O15360	1455 aa		42.7	■■■■■ 4.43
NFKBIA-209	ENST00000557389	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.7	■■■■■ 4.43
NFKBIA-209	ENST00000557389	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.66	■■■■■ 4.42
NFKBIA-209	ENST00000557389	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.63	■■■■■ 4.41
NFKBIA-209	ENST00000557389	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.63	■■■■■ 4.41
NFKBIA-209	ENST00000557389	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
NFKBIA-209	ENST00000557389	ABCC1	P33527	1531 aa		42.61	■■■■■ 4.41
NFKBIA-209	ENST00000557389	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.57	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.56	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.55	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	DAPK1	P53355	1430 aa		42.54	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NFKBIA-209	ENST00000557389	ABCC5	O15440	1437 aa		42.5	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.5	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.49	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	NEO1	Q92859	1461 aa		42.49	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.48	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.46	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.45	■■■■■ 4.39
NFKBIA-209	ENST00000557389	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.42	■■■■■ 4.38
NFKBIA-209	ENST00000557389	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.4	■■■■■ 4.38
NFKBIA-209	ENST00000557389	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.39	■■■■■ 4.38
NFKBIA-209	ENST00000557389	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.39	■■■■■ 4.38
NFKBIA-209	ENST00000557389	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NFKBIA-209	ENST00000557389	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.32	■■■■■ 4.37
NFKBIA-209	ENST00000557389	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.31	■■■■■ 4.36
NFKBIA-209	ENST00000557389	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.29	■■■■■ 4.36
NFKBIA-209	ENST00000557389	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.29	■■■■■ 4.36
NFKBIA-209	ENST00000557389	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.27	■■■■■ 4.36
NFKBIA-209	ENST00000557389	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.27	■■■■■ 4.36
NFKBIA-209	ENST00000557389	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.26	■■■■■ 4.36
NFKBIA-209	ENST00000557389	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.25	■■■■■ 4.35
NFKBIA-209	ENST00000557389	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
NFKBIA-209	ENST00000557389	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.23	■■■■■ 4.35
NFKBIA-209	ENST00000557389	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.22	■■■■■ 4.35
NFKBIA-209	ENST00000557389	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.21	■■■■■ 4.35
NFKBIA-209	ENST00000557389	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.21	■■■■■ 4.35
NFKBIA-209	ENST00000557389	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.18	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	KDM5C	P41229	1560 aa		42.17	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.17	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.17	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.16	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.15	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.14	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.14	■■■■■ 4.34
NFKBIA-209	ENST00000557389	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.13	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	NAIP	Q13075	1403 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.11	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.11	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.1	■■■■■ 4.33
NFKBIA-209	ENST00000557389	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.06	■■■■■ 4.32
NFKBIA-209	ENST00000557389	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
NFKBIA-209	ENST00000557389	KDM6B	O15054	1643 aa		42.04	■■■■■ 4.32
NFKBIA-209	ENST00000557389	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.04	■■■■■ 4.32
NFKBIA-209	ENST00000557389	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.03	■■■■■ 4.32
NFKBIA-209	ENST00000557389	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42	■■■■■ 4.31
NFKBIA-209	ENST00000557389	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42	■■■■■ 4.31
NFKBIA-209	ENST00000557389	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.96	■■■■■ 4.31
NFKBIA-209	ENST00000557389	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.93	■■■■■ 4.3
NFKBIA-209	ENST00000557389	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.91	■■■■■ 4.3
NFKBIA-209	ENST00000557389	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.88	■■■■■ 4.3
NFKBIA-209	ENST00000557389	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.86	■■■■■ 4.29
NFKBIA-209	ENST00000557389	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.82	■■■■■ 4.29
NFKBIA-209	ENST00000557389	A2M	P01023	1474 aa		41.79	■■■■■ 4.28
NFKBIA-209	ENST00000557389	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.79	■■■■■ 4.28
NFKBIA-209	ENST00000557389	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.76	■■■■■ 4.28
NFKBIA-209	ENST00000557389	HRC	P23327	699 aa		41.74	■■■■■ 4.27
NFKBIA-209	ENST00000557389	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.73	■■■■■ 4.27
NFKBIA-209	ENST00000557389	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
NFKBIA-209	ENST00000557389	TRIM52	Q96A61	297 aa		41.7	■■■■■ 4.27
NFKBIA-209	ENST00000557389	ATP10A	O60312	1499 aa		41.66	■■■■■ 4.26
NFKBIA-209	ENST00000557389	UNC13B	O14795	1591 aa		41.66	■■■■■ 4.26
NFKBIA-209	ENST00000557389	KIF3B	O15066	747 aa		41.59	■■■■■ 4.25
NFKBIA-209	ENST00000557389	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.59	■■■■■ 4.25
NFKBIA-209	ENST00000557389	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.59	■■■■■ 4.25
NFKBIA-209	ENST00000557389	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
NFKBIA-209	ENST00000557389	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.58	■■■■■ 4.25

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