RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555117.1

COCH-208, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-208ENST00000555117 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.03■■■■□ 3.36
COCH-208ENST00000555117 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
COCH-208ENST00000555117 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.01■■■■□ 3.36
COCH-208ENST00000555117 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.99■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.99■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.98■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.98■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 MADDQ8WXG6 1647 aa35.97■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.96■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 PTPRMP28827 1452 aa35.96■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.95■■■■□ 3.35
COCH-208ENST00000555117 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.94■■■■□ 3.34
COCH-208ENST00000555117 PREX2Q70Z35 1606 aa35.91■■■■□ 3.34
COCH-208ENST00000555117 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
COCH-208ENST00000555117 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.85■■■■□ 3.33
COCH-208ENST00000555117 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.83■■■■□ 3.33
COCH-208ENST00000555117 KDM5CP41229 1560 aa35.81■■■■□ 3.32
COCH-208ENST00000555117 ATP10AO60312 1499 aa35.78■■■■□ 3.32
COCH-208ENST00000555117 ABCC1P33527 1531 aa35.77■■■■□ 3.32
COCH-208ENST00000555117 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.75■■■■□ 3.31
COCH-208ENST00000555117 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.75■■■■□ 3.31
COCH-208ENST00000555117 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.74■■■■□ 3.31
COCH-208ENST00000555117 AFAP1Q8N556 730 aa35.74■■■■□ 3.31
COCH-208ENST00000555117 MLECQ14165 292 aa35.7■■■■□ 3.31
COCH-208ENST00000555117 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.7■■■■□ 3.31
COCH-208ENST00000555117 CEP162Q5TB80 1403 aa35.69■■■■□ 3.3
COCH-208ENST00000555117 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.68■■■■□ 3.3
COCH-208ENST00000555117 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.66■■■■□ 3.3
COCH-208ENST00000555117 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.66■■■■□ 3.3
COCH-208ENST00000555117 ABCA6Q8N139 1617 aa35.65■■■■□ 3.3
COCH-208ENST00000555117 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.64■■■■□ 3.3
COCH-208ENST00000555117 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.63■■■■□ 3.29
COCH-208ENST00000555117 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
COCH-208ENST00000555117 REREQ9P2R6 1566 aa35.6■■■■□ 3.29
COCH-208ENST00000555117 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.6■■■■□ 3.29
COCH-208ENST00000555117 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.6■■■■□ 3.29
COCH-208ENST00000555117 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.59■■■■□ 3.29
COCH-208ENST00000555117 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.57■■■■□ 3.28
COCH-208ENST00000555117 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
COCH-208ENST00000555117 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.56■■■■□ 3.28
COCH-208ENST00000555117 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.56■■■■□ 3.28
COCH-208ENST00000555117 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.53■■■■□ 3.28
COCH-208ENST00000555117 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.52■■■■□ 3.28
COCH-208ENST00000555117 TIAM1Q13009 1591 aa35.48■■■■□ 3.27
COCH-208ENST00000555117 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
COCH-208ENST00000555117 AGLP35573 1532 aa35.47■■■■□ 3.27
COCH-208ENST00000555117 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.46■■■■□ 3.27
COCH-208ENST00000555117 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.26
COCH-208ENST00000555117 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.43■■■■□ 3.26
COCH-208ENST00000555117 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
COCH-208ENST00000555117 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.39■■■■□ 3.26
COCH-208ENST00000555117 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 ATP7AQ04656 1500 aa35.37■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 HSPA2P54652 639 aa35.35■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 C3P01024 1663 aa35.33■■■■□ 3.25
COCH-208ENST00000555117 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.31■■■■□ 3.24
COCH-208ENST00000555117 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
COCH-208ENST00000555117 NCOA2Q15596 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
COCH-208ENST00000555117 PLXNC1O60486 1568 aa35.26■■■■□ 3.24
COCH-208ENST00000555117 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
COCH-208ENST00000555117 MBD5Q9P267 1494 aa35.24■■■■□ 3.23
COCH-208ENST00000555117 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
COCH-208ENST00000555117 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.24■■■■□ 3.23
COCH-208ENST00000555117 A2MP01023 1474 aa35.23■■■■□ 3.23
COCH-208ENST00000555117 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.21■■■■□ 3.23
COCH-208ENST00000555117 MROH2AA6NES4 1674 aa35.2■■■■□ 3.23
COCH-208ENST00000555117 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.19■■■■□ 3.22
COCH-208ENST00000555117 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.17■■■■□ 3.22
COCH-208ENST00000555117 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.17■■■■□ 3.22
COCH-208ENST00000555117 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
COCH-208ENST00000555117 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.12■■■■□ 3.21
COCH-208ENST00000555117 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.12■■■■□ 3.21
COCH-208ENST00000555117 MAP3K1Q13233 1512 aa35.11■■■■□ 3.21
COCH-208ENST00000555117 STRCQ7RTU9 1775 aa35.08■■■■□ 3.21
COCH-208ENST00000555117 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.04■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 ZMYM3Q14202 1370 aa35.04■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 GGT6Q6P531 493 aa35.04■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 FBXO41Q8TF61 875 aa35.02■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 NPATQ14207 1427 aa35.01■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.01■■■■□ 3.2
COCH-208ENST00000555117 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
COCH-208ENST00000555117 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.93■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.92■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.91■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.91■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 TSPY4P0CV99 314 aa34.9■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 TSPY10P0CW01 314 aa34.9■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 PTPRKQ15262 1439 aa34.89■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 MIA2Q96PC5 1412 aa34.89■■■■□ 3.18
COCH-208ENST00000555117 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.88■■■■□ 3.17
COCH-208ENST00000555117 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
COCH-208ENST00000555117 KIF3BO15066 747 aa34.87■■■■□ 3.17
COCH-208ENST00000555117 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.84■■■■□ 3.17
COCH-208ENST00000555117 NCOA1Q15788 1441 aa34.84■■■■□ 3.17
COCH-208ENST00000555117 APLP2Q06481 763 aa34.83■■■■□ 3.17
COCH-208ENST00000555117 PTPRTO14522 1441 aa34.82■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms