RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554567.1

KTN1-215, Transcript of kinectin 1, human

TSL 5

Gene KTN1, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KTN1-215	ENST00000554567	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.79	■■■■■ 4.6
KTN1-215	ENST00000554567	MLEC	Q14165	292 aa		43.77	■■■■■ 4.6
KTN1-215	ENST00000554567	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.75	■■■■■ 4.59
KTN1-215	ENST00000554567	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.75	■■■■■ 4.59
KTN1-215	ENST00000554567	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.73	■■■■■ 4.59
KTN1-215	ENST00000554567	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.71	■■■■■ 4.59
KTN1-215	ENST00000554567	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.71	■■■■■ 4.59
KTN1-215	ENST00000554567	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.67	■■■■■ 4.58
KTN1-215	ENST00000554567	KIF14	Q15058	1648 aa		43.63	■■■■■ 4.58
KTN1-215	ENST00000554567	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.63	■■■■■ 4.57
KTN1-215	ENST00000554567	HSPA2	P54652	639 aa		43.62	■■■■■ 4.57
KTN1-215	ENST00000554567	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.6	■■■■■ 4.57
KTN1-215	ENST00000554567	ATP10A	O60312	1499 aa		43.57	■■■■■ 4.57
KTN1-215	ENST00000554567	CLIP1	P30622	1438 aa		43.56	■■■■■ 4.56
KTN1-215	ENST00000554567	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.54	■■■■■ 4.56
KTN1-215	ENST00000554567	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.53	■■■■■ 4.56
KTN1-215	ENST00000554567	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.52	■■■■■ 4.56
KTN1-215	ENST00000554567	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.52	■■■■■ 4.56
KTN1-215	ENST00000554567	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.51	■■■■■ 4.56
KTN1-215	ENST00000554567	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.5	■■■■■ 4.55
KTN1-215	ENST00000554567	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.46	■■■■■ 4.55
KTN1-215	ENST00000554567	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.41	■■■■■ 4.54
KTN1-215	ENST00000554567	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.53
KTN1-215	ENST00000554567	KDM5C	P41229	1560 aa		43.35	■■■■■ 4.53
KTN1-215	ENST00000554567	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.35	■■■■■ 4.53
KTN1-215	ENST00000554567	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.35	■■■■■ 4.53
KTN1-215	ENST00000554567	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.32	■■■■■ 4.52
KTN1-215	ENST00000554567	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.25	■■■■■ 4.51
KTN1-215	ENST00000554567	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.25	■■■■■ 4.51
KTN1-215	ENST00000554567	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.24	■■■■■ 4.51
KTN1-215	ENST00000554567	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.21	■■■■■ 4.51
KTN1-215	ENST00000554567	ABCC1	P33527	1531 aa		43.19	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.19	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.18	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.16	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.14	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.13	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.13	■■■■■ 4.5
KTN1-215	ENST00000554567	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.13	■■■■■ 4.49
KTN1-215	ENST00000554567	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.12	■■■■■ 4.49
KTN1-215	ENST00000554567	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.07	■■■■■ 4.49
KTN1-215	ENST00000554567	AGL	P35573	1532 aa		43.04	■■■■■ 4.48
KTN1-215	ENST00000554567	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.03	■■■■■ 4.48
KTN1-215	ENST00000554567	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
KTN1-215	ENST00000554567	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43	■■■■■ 4.47	2e-7	■■□□□ 13
KTN1-215	ENST00000554567	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.99	■■■■■ 4.47
KTN1-215	ENST00000554567	C3	P01024	1663 aa		42.98	■■■■■ 4.47
KTN1-215	ENST00000554567	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
KTN1-215	ENST00000554567	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.96	■■■■■ 4.47
KTN1-215	ENST00000554567	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
KTN1-215	ENST00000554567	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.94	■■■■■ 4.46
KTN1-215	ENST00000554567	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.94	■■■■■ 4.46
KTN1-215	ENST00000554567	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
KTN1-215	ENST00000554567	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.88	■■■■■ 4.45
KTN1-215	ENST00000554567	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.86	■■■■■ 4.45
KTN1-215	ENST00000554567	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.85	■■■■■ 4.45
KTN1-215	ENST00000554567	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
KTN1-215	ENST00000554567	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.79	■■■■■ 4.44
KTN1-215	ENST00000554567	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.78	■■■■■ 4.44
KTN1-215	ENST00000554567	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.76	■■■■■ 4.44
KTN1-215	ENST00000554567	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.74	■■■■■ 4.43
KTN1-215	ENST00000554567	PTPRT	O14522	1441 aa		42.71	■■■■■ 4.43
KTN1-215	ENST00000554567	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
KTN1-215	ENST00000554567	A2M	P01023	1474 aa		42.69	■■■■■ 4.42
KTN1-215	ENST00000554567	GGT6	Q6P531	493 aa		42.69	■■■■■ 4.42
KTN1-215	ENST00000554567	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
KTN1-215	ENST00000554567	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.67	■■■■■ 4.42
KTN1-215	ENST00000554567	NPAT	Q14207	1427 aa		42.65	■■■■■ 4.42
KTN1-215	ENST00000554567	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.63	■■■■■ 4.41
KTN1-215	ENST00000554567	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
KTN1-215	ENST00000554567	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.61	■■■■■ 4.41
KTN1-215	ENST00000554567	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.61	■■■■■ 4.41
KTN1-215	ENST00000554567	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.57	■■■■■ 4.41
KTN1-215	ENST00000554567	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.57	■■■■■ 4.41
KTN1-215	ENST00000554567	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.54	■■■■■ 4.4
KTN1-215	ENST00000554567	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.53	■■■■■ 4.4
KTN1-215	ENST00000554567	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KTN1-215	ENST00000554567	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KTN1-215	ENST00000554567	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.48	■■■■■ 4.39
KTN1-215	ENST00000554567	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.48	■■■■■ 4.39
KTN1-215	ENST00000554567	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.46	■■■■■ 4.39
KTN1-215	ENST00000554567	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.43	■■■■■ 4.38
KTN1-215	ENST00000554567	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.42	■■■■■ 4.38
KTN1-215	ENST00000554567	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
KTN1-215	ENST00000554567	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.37	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	KIF3B	O15066	747 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	PKD2	Q13563	968 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.34	■■■■■ 4.37
KTN1-215	ENST00000554567	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KTN1-215	ENST00000554567	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KTN1-215	ENST00000554567	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KTN1-215	ENST00000554567	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.29	■■■■■ 4.36
KTN1-215	ENST00000554567	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.28	■■■■■ 4.36
KTN1-215	ENST00000554567	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
KTN1-215	ENST00000554567	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
KTN1-215	ENST00000554567	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.22	■■■■■ 4.35

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