RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 POGZQ7Z3K3 1410 aa52.24■■■■■ 5.95
TTC7B-202ENST00000553948 ADAMTSL3P82987 1691 aa52.23■■■■■ 5.95
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGAP5Q13017 1502 aa52.22■■■■■ 5.95
TTC7B-202ENST00000553948 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa52.2■■■■■ 5.95
TTC7B-202ENST00000553948 MAGI2Q86UL8 1455 aa52.2■■■■■ 5.95
TTC7B-202ENST00000553948 BCORL1Q5H9F3 1711 aa52.18■■■■■ 5.94
TTC7B-202ENST00000553948 YEATS2Q9ULM3 1422 aa52.14■■■■■ 5.94
TTC7B-202ENST00000553948 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa52.09■■■■■ 5.93
TTC7B-202ENST00000553948 HECW2Q9P2P5 1572 aa52.08■■■■■ 5.93
TTC7B-202ENST00000553948 PREX2Q70Z35 1606 aa52.06■■■■■ 5.92
TTC7B-202ENST00000553948 PTPRMP28827 1452 aa52.05■■■■■ 5.92
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa52.03■■■■■ 5.92
TTC7B-202ENST00000553948 MADDQ8WXG6 1647 aa52.02■■■■■ 5.92
TTC7B-202ENST00000553948 CEP162Q5TB80 1403 aa51.99■■■■■ 5.91
TTC7B-202ENST00000553948 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa51.95■■■■■ 5.91
TTC7B-202ENST00000553948 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa51.94■■■■■ 5.91
TTC7B-202ENST00000553948 AFAP1Q8N556 730 aa51.92■■■■■ 5.9
TTC7B-202ENST00000553948 ATP10AO60312 1499 aa51.92■■■■■ 5.9
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TTC7B-202ENST00000553948 MYT1LQ9UL68 1186 aa51.81■■■■■ 5.88
TTC7B-202ENST00000553948 MTUS2Q5JR59 1369 aa51.81■■■■■ 5.88
TTC7B-202ENST00000553948 ITSN2Q9NZM3 1697 aa51.8■■■■■ 5.88
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa51.79■■■■■ 5.88
TTC7B-202ENST00000553948 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
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TTC7B-202ENST00000553948 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa51.77■■■■■ 5.88
TTC7B-202ENST00000553948 MLH3Q9UHC1 1453 aa51.73■■■■■ 5.87
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TTC7B-202ENST00000553948 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa51.7■■■■■ 5.87
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TTC7B-202ENST00000553948 CCNB3Q8WWL7 1395 aa51.69■■■■■ 5.86
TTC7B-202ENST00000553948 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa51.68■■■■■ 5.86
TTC7B-202ENST00000553948 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa51.67■■■■■ 5.86
TTC7B-202ENST00000553948 ABCA6Q8N139 1617 aa51.64■■■■■ 5.86
TTC7B-202ENST00000553948 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa51.64■■■■■ 5.86
TTC7B-202ENST00000553948 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP51.62■■■■■ 5.85
TTC7B-202ENST00000553948 REREQ9P2R6 1566 aa51.6■■■■■ 5.85
TTC7B-202ENST00000553948 SYCP2Q9BX26 1530 aa51.59■■■■■ 5.85
TTC7B-202ENST00000553948 PLPPR3Q6T4P5 718 aa51.57■■■■■ 5.85
TTC7B-202ENST00000553948 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa51.55■■■■■ 5.84
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa51.54■■■■■ 5.84
TTC7B-202ENST00000553948 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP51.52■■■■■ 5.846e-8■■■■■ 34
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TTC7B-202ENST00000553948 LMTK3Q96Q04 1460 aa51.48■■■■■ 5.83
TTC7B-202ENST00000553948 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP51.44■■■■■ 5.83
TTC7B-202ENST00000553948 AGLP35573 1532 aa51.43■■■■■ 5.82
TTC7B-202ENST00000553948 VPS8Q8N3P4 1428 aa51.43■■■■■ 5.82
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TTC7B-202ENST00000553948 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP51.32■■■■■ 5.81
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TTC7B-202ENST00000553948 A2MP01023 1474 aa51.14■■■■■ 5.78
TTC7B-202ENST00000553948 MAP3K1Q13233 1512 aa51.12■■■■■ 5.77
TTC7B-202ENST00000553948 C3P01024 1663 aa51.11■■■■■ 5.77
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TTC7B-202ENST00000553948 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa51.05■■■■■ 5.76
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TTC7B-202ENST00000553948 CCDC141Q6ZP82 1450 aa51.02■■■■■ 5.76
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TTC7B-202ENST00000553948 MROH2AA6NES4 1674 aa50.95■■■■■ 5.75
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TTC7B-202ENST00000553948 ZMYM3Q14202 1370 aa50.86■■■■■ 5.73
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TTC7B-202ENST00000553948 TSPY10P0CW01 314 aa50.8■■■■■ 5.72
TTC7B-202ENST00000553948 PPP6R1Q9UPN7 881 aa50.8■■■■■ 5.72
TTC7B-202ENST00000553948 NPATQ14207 1427 aa50.79■■■■■ 5.72
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TTC7B-202ENST00000553948 MAST1Q9Y2H9 1570 aa50.64■■■■■ 5.7
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TTC7B-202ENST00000553948 PTPRKQ15262 1439 aa50.62■■■■■ 5.69
TTC7B-202ENST00000553948 FAM135AQ9P2D6 1515 aa50.53■■■■■ 5.68
TTC7B-202ENST00000553948 KDM5DQ9BY66 1539 aa50.52■■■■■ 5.68
TTC7B-202ENST00000553948 MYO3AQ8NEV4 1616 aa50.51■■■■■ 5.68
TTC7B-202ENST00000553948 PTPN23Q9H3S7 1636 aa50.48■■■■■ 5.67
TTC7B-202ENST00000553948 NCOA1Q15788 1441 aa50.47■■■■■ 5.67
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