RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553789.5

RPS6KL1-204, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KL1, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-204ENST00000553789 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-204ENST00000553789 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1-204ENST00000553789 NCOA2Q15596 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1-204ENST00000553789 FANCAO15360 1455 aa23.29■■□□□ 1.32
RPS6KL1-204ENST00000553789 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RPS6KL1-204ENST00000553789 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.28■■□□□ 1.32
RPS6KL1-204ENST00000553789 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-204ENST00000553789 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RPS6KL1-204ENST00000553789 AKNAQ7Z591 1439 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KL1-204ENST00000553789 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-204ENST00000553789 PREX2Q70Z35 1606 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KL1-204ENST00000553789 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KL1-204ENST00000553789 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 MIA2Q96PC5 1412 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-204ENST00000553789 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-204ENST00000553789 RAPGEF3O95398 923 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-204ENST00000553789 ABCC1P33527 1531 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-204ENST00000553789 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-204ENST00000553789 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.08■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 FBXO41Q8TF61 875 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.04■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 AFAP1Q8N556 730 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 MBD5Q9P267 1494 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-204ENST00000553789 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 PTPRMP28827 1452 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 RICTORQ6R327 1708 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 KDM5CP41229 1560 aa22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 TSPY4P0CV99 314 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 TSPY10P0CW01 314 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1-204ENST00000553789 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.89■■□□□ 1.26
RPS6KL1-204ENST00000553789 ATP10AO60312 1499 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 ABCC5O15440 1437 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 DAPK1P53355 1430 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 ATP7AQ04656 1500 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 MADDQ8WXG6 1647 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-204ENST00000553789 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 REREQ9P2R6 1566 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KL1-204ENST00000553789 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 HSPA2P54652 639 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 ABCA6Q8N139 1617 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.74■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 A2MP01023 1474 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 ROCK1Q13464 1354 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 NCOA1Q15788 1441 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 ADGRL2O95490 1459 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 PLXNC1O60486 1568 aa22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 AGLP35573 1532 aa22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1-204ENST00000553789 PTPRKQ15262 1439 aa22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 KIF15Q9NS87 1388 aa22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 ITGAEP38570 1179 aa22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 MLECQ14165 292 aa22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-204ENST00000553789 CERKQ8TCT0 537 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms