RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552351.5

CHPT1-210, Transcript of choline phosphotransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CHPT1, Length 1,524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1-210ENST00000552351 AKNAQ7Z591 1439 aa42.38■■■■■ 4.37
CHPT1-210ENST00000552351 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.37■■■■■ 4.37
CHPT1-210ENST00000552351 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.37■■■■■ 4.37
CHPT1-210ENST00000552351 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
CHPT1-210ENST00000552351 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.31■■■■■ 4.36
CHPT1-210ENST00000552351 NCOA2Q15596 1464 aa42.29■■■■■ 4.36
CHPT1-210ENST00000552351 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.28■■■■■ 4.36
CHPT1-210ENST00000552351 ADGRL1O94910 1474 aa42.26■■■■■ 4.36
CHPT1-210ENST00000552351 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
CHPT1-210ENST00000552351 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
CHPT1-210ENST00000552351 RICTORQ6R327 1708 aa42.19■■■■■ 4.35
CHPT1-210ENST00000552351 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.18■■■■■ 4.34
CHPT1-210ENST00000552351 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.17■■■■■ 4.34
CHPT1-210ENST00000552351 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
CHPT1-210ENST00000552351 RAPGEF3O95398 923 aa42.14■■■■■ 4.34
CHPT1-210ENST00000552351 ABCC1P33527 1531 aa42.14■■■■■ 4.34
CHPT1-210ENST00000552351 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.12■■■■■ 4.33
CHPT1-210ENST00000552351 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.1■■■■■ 4.33
CHPT1-210ENST00000552351 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.08■■■■■ 4.33
CHPT1-210ENST00000552351 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.07■■■■■ 4.33
CHPT1-210ENST00000552351 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.06■■■■■ 4.32
CHPT1-210ENST00000552351 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.03■■■■■ 4.32
CHPT1-210ENST00000552351 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
CHPT1-210ENST00000552351 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42■■■■■ 4.31
CHPT1-210ENST00000552351 MAGI2Q86UL8 1455 aa42■■■■■ 4.31
CHPT1-210ENST00000552351 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42■■■■■ 4.31
CHPT1-210ENST00000552351 KDM5CP41229 1560 aa41.98■■■■■ 4.31
CHPT1-210ENST00000552351 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.96■■■■■ 4.31
CHPT1-210ENST00000552351 MIA2Q96PC5 1412 aa41.96■■■■■ 4.31
CHPT1-210ENST00000552351 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.91■■■■■ 4.3
CHPT1-210ENST00000552351 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.9■■■■■ 4.3
CHPT1-210ENST00000552351 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.89■■■■■ 4.3
CHPT1-210ENST00000552351 AFAP1Q8N556 730 aa41.89■■■■■ 4.3
CHPT1-210ENST00000552351 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.87■■■■■ 4.29
CHPT1-210ENST00000552351 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
CHPT1-210ENST00000552351 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.86■■■■■ 4.29
CHPT1-210ENST00000552351 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.85■■■■■ 4.29
CHPT1-210ENST00000552351 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.299e-7■■■■■ 28.4
CHPT1-210ENST00000552351 MBD5Q9P267 1494 aa41.84■■■■■ 4.29
CHPT1-210ENST00000552351 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.79■■■■■ 4.28
CHPT1-210ENST00000552351 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.77■■■■■ 4.28
CHPT1-210ENST00000552351 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.77■■■■■ 4.28
CHPT1-210ENST00000552351 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.77■■■■■ 4.28
CHPT1-210ENST00000552351 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.73■■■■■ 4.27
CHPT1-210ENST00000552351 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.73■■■■■ 4.27
CHPT1-210ENST00000552351 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.73■■■■■ 4.27
CHPT1-210ENST00000552351 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CHPT1-210ENST00000552351 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CHPT1-210ENST00000552351 ATP10AO60312 1499 aa41.69■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.67■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 ATP7AQ04656 1500 aa41.67■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.66■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 ABCA6Q8N139 1617 aa41.66■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.64■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 REREQ9P2R6 1566 aa41.64■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.64■■■■■ 4.26
CHPT1-210ENST00000552351 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CHPT1-210ENST00000552351 TSPY4P0CV99 314 aa41.55■■■■■ 4.24
CHPT1-210ENST00000552351 TSPY10P0CW01 314 aa41.55■■■■■ 4.24
CHPT1-210ENST00000552351 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.54■■■■■ 4.24
CHPT1-210ENST00000552351 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.53■■■■■ 4.24
CHPT1-210ENST00000552351 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CHPT1-210ENST00000552351 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.51■■■■■ 4.24
CHPT1-210ENST00000552351 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.49■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.48■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.48■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 AGLP35573 1532 aa41.47■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.45■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 ABCC5O15440 1437 aa41.45■■■■■ 4.23
CHPT1-210ENST00000552351 DAPK1P53355 1430 aa41.44■■■■■ 4.22
CHPT1-210ENST00000552351 PLXNC1O60486 1568 aa41.42■■■■■ 4.22
CHPT1-210ENST00000552351 A2MP01023 1474 aa41.42■■■■■ 4.22
CHPT1-210ENST00000552351 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.41■■■■■ 4.22
CHPT1-210ENST00000552351 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.226e-6■□□□□ 11
CHPT1-210ENST00000552351 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CHPT1-210ENST00000552351 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
CHPT1-210ENST00000552351 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CHPT1-210ENST00000552351 MADDQ8WXG6 1647 aa41.26■■■■■ 4.2
CHPT1-210ENST00000552351 ADGRL2O95490 1459 aa41.22■■■■■ 4.19
CHPT1-210ENST00000552351 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.22■■■■■ 4.19
CHPT1-210ENST00000552351 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.21■■■■■ 4.19
CHPT1-210ENST00000552351 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.21■■■■■ 4.19
CHPT1-210ENST00000552351 MLECQ14165 292 aa41.21■■■■■ 4.19
CHPT1-210ENST00000552351 KIF15Q9NS87 1388 aa41.17■■■■■ 4.18
CHPT1-210ENST00000552351 NCOA1Q15788 1441 aa41.17■■■■■ 4.18
CHPT1-210ENST00000552351 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
CHPT1-210ENST00000552351 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
CHPT1-210ENST00000552351 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
CHPT1-210ENST00000552351 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.13■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 PTPRMP28827 1452 aa41.11■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 PTPRKQ15262 1439 aa41.11■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 ERBINQ96RT1 1412 aa41.11■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.09■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.09■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 ROCK1Q13464 1354 aa41.09■■■■■ 4.17
CHPT1-210ENST00000552351 KIF3BO15066 747 aa41.07■■■■■ 4.16
CHPT1-210ENST00000552351 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.05■■■■■ 4.16
CHPT1-210ENST00000552351 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms