RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551738.1

CRIP2-209, Transcript of cysteine rich protein 2, human

TSL 3

Gene CRIP2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRIP2-209	ENST00000551738	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.87	■■■■■ 4.61
CRIP2-209	ENST00000551738	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.87	■■■■■ 4.61
CRIP2-209	ENST00000551738	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.87	■■■■■ 4.61
CRIP2-209	ENST00000551738	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.83	■■■■■ 4.61
CRIP2-209	ENST00000551738	KIF14	Q15058	1648 aa		43.81	■■■■■ 4.6
CRIP2-209	ENST00000551738	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.81	■■■■■ 4.6
CRIP2-209	ENST00000551738	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.78	■■■■■ 4.6
CRIP2-209	ENST00000551738	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.76	■■■■■ 4.6
CRIP2-209	ENST00000551738	CLIP1	P30622	1438 aa		43.73	■■■■■ 4.59
CRIP2-209	ENST00000551738	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.7	■■■■■ 4.59
CRIP2-209	ENST00000551738	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.7	■■■■■ 4.59
CRIP2-209	ENST00000551738	MLEC	Q14165	292 aa		43.69	■■■■■ 4.58
CRIP2-209	ENST00000551738	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.68	■■■■■ 4.58
CRIP2-209	ENST00000551738	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.67	■■■■■ 4.58
CRIP2-209	ENST00000551738	ATP10A	O60312	1499 aa		43.66	■■■■■ 4.58
CRIP2-209	ENST00000551738	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.65	■■■■■ 4.58
CRIP2-209	ENST00000551738	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.63	■■■■■ 4.57
CRIP2-209	ENST00000551738	KDM5C	P41229	1560 aa		43.56	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.56	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.56	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.54	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	HSPA2	P54652	639 aa		43.54	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.54	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.51	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.51	■■■■■ 4.56
CRIP2-209	ENST00000551738	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.48	■■■■■ 4.55
CRIP2-209	ENST00000551738	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.46	■■■■■ 4.55
CRIP2-209	ENST00000551738	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.43	■■■■■ 4.54
CRIP2-209	ENST00000551738	ABCC1	P33527	1531 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CRIP2-209	ENST00000551738	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.38	■■■■■ 4.54
CRIP2-209	ENST00000551738	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CRIP2-209	ENST00000551738	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CRIP2-209	ENST00000551738	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CRIP2-209	ENST00000551738	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.34	■■■■■ 4.53
CRIP2-209	ENST00000551738	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CRIP2-209	ENST00000551738	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CRIP2-209	ENST00000551738	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.31	■■■■■ 4.52
CRIP2-209	ENST00000551738	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.31	■■■■■ 4.52
CRIP2-209	ENST00000551738	AGL	P35573	1532 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CRIP2-209	ENST00000551738	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.18	■■■■■ 4.5
CRIP2-209	ENST00000551738	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CRIP2-209	ENST00000551738	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
CRIP2-209	ENST00000551738	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CRIP2-209	ENST00000551738	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
CRIP2-209	ENST00000551738	C3	P01024	1663 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CRIP2-209	ENST00000551738	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
CRIP2-209	ENST00000551738	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CRIP2-209	ENST00000551738	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
CRIP2-209	ENST00000551738	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.06	■■■■■ 4.48
CRIP2-209	ENST00000551738	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.01	■■■■■ 4.48
CRIP2-209	ENST00000551738	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		43	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.98	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.98	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CRIP2-209	ENST00000551738	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CRIP2-209	ENST00000551738	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
CRIP2-209	ENST00000551738	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
CRIP2-209	ENST00000551738	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CRIP2-209	ENST00000551738	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CRIP2-209	ENST00000551738	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CRIP2-209	ENST00000551738	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.82	■■■■■ 4.44
CRIP2-209	ENST00000551738	A2M	P01023	1474 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CRIP2-209	ENST00000551738	PTPRT	O14522	1441 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CRIP2-209	ENST00000551738	NPAT	Q14207	1427 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CRIP2-209	ENST00000551738	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CRIP2-209	ENST00000551738	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CRIP2-209	ENST00000551738	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CRIP2-209	ENST00000551738	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CRIP2-209	ENST00000551738	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CRIP2-209	ENST00000551738	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CRIP2-209	ENST00000551738	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CRIP2-209	ENST00000551738	GGT6	Q6P531	493 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CRIP2-209	ENST00000551738	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CRIP2-209	ENST00000551738	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CRIP2-209	ENST00000551738	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CRIP2-209	ENST00000551738	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CRIP2-209	ENST00000551738	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.4
CRIP2-209	ENST00000551738	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CRIP2-209	ENST00000551738	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CRIP2-209	ENST00000551738	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CRIP2-209	ENST00000551738	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
CRIP2-209	ENST00000551738	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CRIP2-209	ENST00000551738	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CRIP2-209	ENST00000551738	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CRIP2-209	ENST00000551738	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CRIP2-209	ENST00000551738	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CRIP2-209	ENST00000551738	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CRIP2-209	ENST00000551738	PKD2	Q13563	968 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CRIP2-209	ENST00000551738	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
CRIP2-209	ENST00000551738	KIF3B	O15066	747 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CRIP2-209	ENST00000551738	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CRIP2-209	ENST00000551738	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CRIP2-209	ENST00000551738	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CRIP2-209	ENST00000551738	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CRIP2-209	ENST00000551738	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.32	■■■■■ 4.37

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