RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 TSPY4P0CV99 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 TSPY10P0CW01 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 MAPKBP1O60336 1514 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 PIP4K2BP78356 416 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 FMN1Q68DA7 1419 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.63□□□□□ -0.55
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CS-212ENST00000548567 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.61□□□□□ -0.55
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CS-212ENST00000548567 ABCA8O94911 1581 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-212ENST00000548567 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.59□□□□□ -0.55
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CS-212ENST00000548567 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-212ENST00000548567 KIF14Q15058 1648 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-212ENST00000548567 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-212ENST00000548567 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.562e-20■□□□□ 10.1
CS-212ENST00000548567 KIF21BO75037 1637 aa11.54□□□□□ -0.56
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CS-212ENST00000548567 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-212ENST00000548567 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-212ENST00000548567 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-212ENST00000548567 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-212ENST00000548567 PTPRMP28827 1452 aa11.47□□□□□ -0.57
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CS-212ENST00000548567 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
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CS-212ENST00000548567 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-212ENST00000548567 C14orf37Q86TY3 774 aa11.46□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 NUTM2FA1L443 756 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 RGL3Q3MIN7 710 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
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CS-212ENST00000548567 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 HECW1Q76N89 1606 aa11.41□□□□□ -0.58
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CS-212ENST00000548567 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-212ENST00000548567 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.41□□□□□ -0.58
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CS-212ENST00000548567 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.38□□□□□ -0.59
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CS-212ENST00000548567 GLI2P10070 1586 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-212ENST00000548567 IDI1Q13907 227 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 LTKP29376 864 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 KIF15Q9NS87 1388 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 STK26Q9P289 416 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 UTRNP46939 3433 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
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CS-212ENST00000548567 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 A2MP01023 1474 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 FBXO41Q8TF61 875 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 MIA2Q96PC5 1412 aa11.27□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.27□□□□□ -0.6
CS-212ENST00000548567 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-212ENST00000548567 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-212ENST00000548567 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-212ENST00000548567 NUP155O75694 1391 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-212ENST00000548567 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-212ENST00000548567 HSPA1LP34931 641 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-212ENST00000548567 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
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