RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548390.5

LETMD1-215, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LETMD1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-215ENST00000548390 GLI2P10070 1586 aa26.4■■□□□ 1.82
LETMD1-215ENST00000548390 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.39■■□□□ 1.81
LETMD1-215ENST00000548390 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.38■■□□□ 1.81
LETMD1-215ENST00000548390 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.35■■□□□ 1.81
LETMD1-215ENST00000548390 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.35■■□□□ 1.81
LETMD1-215ENST00000548390 CD109Q6YHK3 1445 aa26.34■■□□□ 1.81
LETMD1-215ENST00000548390 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.32■■□□□ 1.8
LETMD1-215ENST00000548390 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.32■■□□□ 1.8
LETMD1-215ENST00000548390 DIP2BQ9P265 1576 aa26.32■■□□□ 1.8
LETMD1-215ENST00000548390 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
LETMD1-215ENST00000548390 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.3■■□□□ 1.8
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LETMD1-215ENST00000548390 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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LETMD1-215ENST00000548390 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.24■■□□□ 1.79
LETMD1-215ENST00000548390 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.23■■□□□ 1.79
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LETMD1-215ENST00000548390 DAPK1P53355 1430 aa26.2■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.2■■□□□ 1.78
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LETMD1-215ENST00000548390 ITGAEP38570 1179 aa26.19■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 MBD5Q9P267 1494 aa26.18■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 ABCC5O15440 1437 aa26.18■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 ABCC1P33527 1531 aa26.18■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.17■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 AKNAQ7Z591 1439 aa26.16■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.16■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.15■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.14■■□□□ 1.78
LETMD1-215ENST00000548390 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
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LETMD1-215ENST00000548390 TSPY10P0CW01 314 aa26.13■■□□□ 1.77
LETMD1-215ENST00000548390 PTPRKQ15262 1439 aa26.12■■□□□ 1.77
LETMD1-215ENST00000548390 ROCK1Q13464 1354 aa26.11■■□□□ 1.77
LETMD1-215ENST00000548390 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.1■■□□□ 1.77
LETMD1-215ENST00000548390 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.09■■□□□ 1.77
LETMD1-215ENST00000548390 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.09■■□□□ 1.77
LETMD1-215ENST00000548390 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.06■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.06■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 ADGRL2O95490 1459 aa26.05■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 HFM1A2PYH4 1435 aa26.05■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.04■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.04■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.03■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.03■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.02■■□□□ 1.76
LETMD1-215ENST00000548390 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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LETMD1-215ENST00000548390 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.01■■□□□ 1.75
LETMD1-215ENST00000548390 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.01■■□□□ 1.75
LETMD1-215ENST00000548390 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26■■□□□ 1.75
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LETMD1-215ENST00000548390 TSPOAP1O95153 1857 aa25.94■■□□□ 1.74
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LETMD1-215ENST00000548390 KDM5CP41229 1560 aa25.93■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 PLXNC1O60486 1568 aa25.91■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.91■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 KIF15Q9NS87 1388 aa25.91■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.91■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.9■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.89■■□□□ 1.74
LETMD1-215ENST00000548390 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LETMD1-215ENST00000548390 ATP7AQ04656 1500 aa25.88■■□□□ 1.73
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LETMD1-215ENST00000548390 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.85■■□□□ 1.73
LETMD1-215ENST00000548390 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.84■■□□□ 1.73
LETMD1-215ENST00000548390 RICTORQ6R327 1708 aa25.84■■□□□ 1.73
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LETMD1-215ENST00000548390 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.84■■□□□ 1.73
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LETMD1-215ENST00000548390 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.68■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 ABCA6Q8N139 1617 aa25.67■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 TRIM52Q96A61 297 aa25.67■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.66■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 ATP10AO60312 1499 aa25.66■■□□□ 1.7
LETMD1-215ENST00000548390 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.63■■□□□ 1.69
LETMD1-215ENST00000548390 REREQ9P2R6 1566 aa25.63■■□□□ 1.69
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