RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 ABCA8O94911 1581 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 HECW1Q76N89 1606 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 MAPKBP1O60336 1514 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 PRR29P0C7W0 189 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 ASXL2Q76L83 1435 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-210ENST00000547912 ATP10BO94823 1461 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 ARID3CA6NKF2 412 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 DIP2BQ9P265 1576 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 GLI2P10070 1586 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 EVX2Q03828 476 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 KCNH8Q96L42 1107 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-210ENST00000547912 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 KIF14Q15058 1648 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 MAP3K1Q13233 1512 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 TSPOAP1O95153 1857 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 TIAM1Q13009 1591 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 CD109Q6YHK3 1445 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 CHADLQ6NUI6 762 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-210ENST00000547912 CLCN6P51797 869 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 NEO1Q92859 1461 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 PLCH2O75038 1416 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 FANCAO15360 1455 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 PREX2Q70Z35 1606 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 GABBR2O75899 941 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 KDM6BO15054 1643 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 NCOA2Q15596 1464 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-210ENST00000547912 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 AKNAQ7Z591 1439 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 ADGRL1O94910 1474 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 MIA2Q96PC5 1412 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 ABCC1P33527 1531 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 RICTORQ6R327 1708 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-210ENST00000547912 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 RAPGEF3O95398 923 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 CREBZFQ9NS37 354 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.32□□□□□ -1.08
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