RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 NCOA2Q15596 1464 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 PREX2Q70Z35 1606 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDSP2-202ENST00000547169 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-202ENST00000547169 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-202ENST00000547169 RAPGEF3O95398 923 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-202ENST00000547169 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
CTDSP2-202ENST00000547169 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.33■■□□□ 1.48
CTDSP2-202ENST00000547169 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP2-202ENST00000547169 ADGRL1O94910 1474 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 AFAP1Q8N556 730 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 RICTORQ6R327 1708 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCC1P33527 1531 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 MIA2Q96PC5 1412 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP2-202ENST00000547169 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 MBD5Q9P267 1494 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDSP2-202ENST00000547169 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 KDM5CP41229 1560 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDSP2-202ENST00000547169 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.08■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 TSPY4P0CV99 314 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 TSPY10P0CW01 314 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 ATP10AO60312 1499 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDSP2-202ENST00000547169 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24■■□□□ 1.43
CTDSP2-202ENST00000547169 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24■■□□□ 1.43
CTDSP2-202ENST00000547169 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCC5O15440 1437 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2-202ENST00000547169 ATP7AQ04656 1500 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2-202ENST00000547169 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
CTDSP2-202ENST00000547169 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.95■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.95■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCA6Q8N139 1617 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.428e-57■■■■■ 114.6
CTDSP2-202ENST00000547169 DAPK1P53355 1430 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 REREQ9P2R6 1566 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDSP2-202ENST00000547169 A2MP01023 1474 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 AGLP35573 1532 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.84■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.83■■□□□ 1.41
CTDSP2-202ENST00000547169 MLECQ14165 292 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 PTPRKQ15262 1439 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 NCOA1Q15788 1441 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 PLXNC1O60486 1568 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 ITGAEP38570 1179 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDSP2-202ENST00000547169 ADGRL2O95490 1459 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF15Q9NS87 1388 aa23.75■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF3BO15066 747 aa23.75■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 ROCK1Q13464 1354 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 GGT6Q6P531 493 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDSP2-202ENST00000547169 MADDQ8WXG6 1647 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDSP2-202ENST00000547169 ERBINQ96RT1 1412 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDSP2-202ENST00000547169 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CTDSP2-202ENST00000547169 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.64■■□□□ 1.37
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