RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545331.5

TULP3-208, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 2

Gene TULP3, Length 1,373 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-208	ENST00000545331	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TULP3-208	ENST00000545331	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TULP3-208	ENST00000545331	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TULP3-208	ENST00000545331	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TULP3-208	ENST00000545331	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TULP3-208	ENST00000545331	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TULP3-208	ENST00000545331	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TULP3-208	ENST00000545331	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TULP3-208	ENST00000545331	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TULP3-208	ENST00000545331	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	ABCC1	P33527	1531 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TULP3-208	ENST00000545331	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TULP3-208	ENST00000545331	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TULP3-208	ENST00000545331	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TULP3-208	ENST00000545331	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TULP3-208	ENST00000545331	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TULP3-208	ENST00000545331	KDM5C	P41229	1560 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TULP3-208	ENST00000545331	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TULP3-208	ENST00000545331	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TULP3-208	ENST00000545331	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TULP3-208	ENST00000545331	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TULP3-208	ENST00000545331	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TULP3-208	ENST00000545331	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TULP3-208	ENST00000545331	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.55	■■■□□ 2.16
TULP3-208	ENST00000545331	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TULP3-208	ENST00000545331	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TULP3-208	ENST00000545331	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	ATP10A	O60312	1499 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.45	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.45	■■■□□ 2.15
TULP3-208	ENST00000545331	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TULP3-208	ENST00000545331	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TULP3-208	ENST00000545331	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
TULP3-208	ENST00000545331	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	AGL	P35573	1532 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TULP3-208	ENST00000545331	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.33	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	A2M	P01023	1474 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	DAPK1	P53355	1430 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	ABCC5	O15440	1437 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
TULP3-208	ENST00000545331	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
TULP3-208	ENST00000545331	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TULP3-208	ENST00000545331	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TULP3-208	ENST00000545331	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TULP3-208	ENST00000545331	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TULP3-208	ENST00000545331	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TULP3-208	ENST00000545331	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TULP3-208	ENST00000545331	MLEC	Q14165	292 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TULP3-208	ENST00000545331	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	PTPRM	P28827	1452 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TULP3-208	ENST00000545331	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TULP3-208	ENST00000545331	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TULP3-208	ENST00000545331	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
TULP3-208	ENST00000545331	KIF3B	O15066	747 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TULP3-208	ENST00000545331	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TULP3-208	ENST00000545331	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TULP3-208	ENST00000545331	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.02	■■■□□ 2.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms