RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.17■■□□□ 1.94
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HOXD8-204ENST00000544999 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.42■■□□□ 1.82
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HOXD8-204ENST00000544999 KIF3BO15066 747 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD8-204ENST00000544999 NPATQ14207 1427 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD8-204ENST00000544999 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD8-204ENST00000544999 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD8-204ENST00000544999 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD8-204ENST00000544999 ABCC5O15440 1437 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD8-204ENST00000544999 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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