RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544213.5

PUS1-210, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-210ENST00000544213 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.15■■■■□ 3.7
PUS1-210ENST00000544213 ADGRL1O94910 1474 aa38.14■■■■□ 3.7
PUS1-210ENST00000544213 RICTORQ6R327 1708 aa38.09■■■■□ 3.69
PUS1-210ENST00000544213 RAPGEF3O95398 923 aa38.09■■■■□ 3.69
PUS1-210ENST00000544213 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
PUS1-210ENST00000544213 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
PUS1-210ENST00000544213 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.07■■■■□ 3.69
PUS1-210ENST00000544213 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.07■■■■□ 3.69
PUS1-210ENST00000544213 APLP2Q06481 763 aa38.07■■■■□ 3.68
PUS1-210ENST00000544213 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.06■■■■□ 3.68
PUS1-210ENST00000544213 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.06■■■■□ 3.68
PUS1-210ENST00000544213 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.01■■■■□ 3.68
PUS1-210ENST00000544213 POGZQ7Z3K3 1410 aa38■■■■□ 3.67
PUS1-210ENST00000544213 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.98■■■■□ 3.67
PUS1-210ENST00000544213 NCOA2Q15596 1464 aa37.96■■■■□ 3.67
PUS1-210ENST00000544213 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
PUS1-210ENST00000544213 ABCC1P33527 1531 aa37.95■■■■□ 3.67
PUS1-210ENST00000544213 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.95■■■■□ 3.67
PUS1-210ENST00000544213 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.94■■■■□ 3.66
PUS1-210ENST00000544213 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.91■■■■□ 3.66
PUS1-210ENST00000544213 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
PUS1-210ENST00000544213 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.89■■■■□ 3.66
PUS1-210ENST00000544213 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
PUS1-210ENST00000544213 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.87■■■■□ 3.65
PUS1-210ENST00000544213 KDM5CP41229 1560 aa37.86■■■■□ 3.65
PUS1-210ENST00000544213 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.86■■■■□ 3.65
PUS1-210ENST00000544213 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.83■■■■□ 3.65
PUS1-210ENST00000544213 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.82■■■■□ 3.65
PUS1-210ENST00000544213 AFAP1Q8N556 730 aa37.79■■■■□ 3.64
PUS1-210ENST00000544213 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.78■■■■□ 3.64
PUS1-210ENST00000544213 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.77■■■■□ 3.64
PUS1-210ENST00000544213 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.76■■■■□ 3.64
PUS1-210ENST00000544213 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.75■■■■□ 3.63
PUS1-210ENST00000544213 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.72■■■■□ 3.63
PUS1-210ENST00000544213 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.7■■■■□ 3.638e-7■■□□□ 13
PUS1-210ENST00000544213 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.7■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.69■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 MIA2Q96PC5 1412 aa37.69■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.68■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 ATP10AO60312 1499 aa37.67■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.65■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.65■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 MBD5Q9P267 1494 aa37.64■■■■□ 3.62
PUS1-210ENST00000544213 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.63■■■■□ 3.61
PUS1-210ENST00000544213 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PUS1-210ENST00000544213 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
PUS1-210ENST00000544213 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.6■■■■□ 3.61
PUS1-210ENST00000544213 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.59■■■■□ 3.61
PUS1-210ENST00000544213 REREQ9P2R6 1566 aa37.58■■■■□ 3.61
PUS1-210ENST00000544213 ABCA6Q8N139 1617 aa37.56■■■■□ 3.6
PUS1-210ENST00000544213 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.56■■■■□ 3.6
PUS1-210ENST00000544213 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.55■■■■□ 3.6
PUS1-210ENST00000544213 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.55■■■■□ 3.6
PUS1-210ENST00000544213 ATP7AQ04656 1500 aa37.54■■■■□ 3.6
PUS1-210ENST00000544213 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
PUS1-210ENST00000544213 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.51■■■■□ 3.59
PUS1-210ENST00000544213 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.5■■■■□ 3.59
PUS1-210ENST00000544213 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.48■■■■□ 3.59
PUS1-210ENST00000544213 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.46■■■■□ 3.59
PUS1-210ENST00000544213 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.46■■■■□ 3.59
PUS1-210ENST00000544213 AGLP35573 1532 aa37.44■■■■□ 3.58
PUS1-210ENST00000544213 TSPY4P0CV99 314 aa37.43■■■■□ 3.58
PUS1-210ENST00000544213 TSPY10P0CW01 314 aa37.43■■■■□ 3.58
PUS1-210ENST00000544213 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.41■■■■□ 3.58
PUS1-210ENST00000544213 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
PUS1-210ENST00000544213 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.35■■■■□ 3.57
PUS1-210ENST00000544213 A2MP01023 1474 aa37.35■■■■□ 3.57
PUS1-210ENST00000544213 MADDQ8WXG6 1647 aa37.35■■■■□ 3.57
PUS1-210ENST00000544213 PLXNC1O60486 1568 aa37.32■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 MLECQ14165 292 aa37.3■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.29■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 PTPRMP28827 1452 aa37.27■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.26■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.26■■■■□ 3.56
PUS1-210ENST00000544213 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
PUS1-210ENST00000544213 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
PUS1-210ENST00000544213 ABCC5O15440 1437 aa37.23■■■■□ 3.55
PUS1-210ENST00000544213 DAPK1P53355 1430 aa37.22■■■■□ 3.55
PUS1-210ENST00000544213 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
PUS1-210ENST00000544213 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
PUS1-210ENST00000544213 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PUS1-210ENST00000544213 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.12■■■■□ 3.53
PUS1-210ENST00000544213 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.12■■■■□ 3.53
PUS1-210ENST00000544213 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.11■■■■□ 3.53
PUS1-210ENST00000544213 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.08■■■■□ 3.53
PUS1-210ENST00000544213 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.05■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 KIF3BO15066 747 aa37.04■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 GGT6Q6P531 493 aa37.04■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 KIF15Q9NS87 1388 aa37.03■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 MROH2AA6NES4 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.01■■■■□ 3.52
PUS1-210ENST00000544213 ADGRL2O95490 1459 aa37.01■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 NCOA1Q15788 1441 aa36.98■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 ERBINQ96RT1 1412 aa36.98■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms