RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.93■■■■□ 3.98
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TM7SF3-212ENST00000543088 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-212ENST00000543088 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.89■■■■□ 3.98
TM7SF3-212ENST00000543088 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.86■■■■□ 3.97
TM7SF3-212ENST00000543088 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.85■■■■□ 3.97
TM7SF3-212ENST00000543088 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.83■■■■□ 3.97
TM7SF3-212ENST00000543088 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.82■■■■□ 3.97
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TM7SF3-212ENST00000543088 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.8■■■■□ 3.96
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TM7SF3-212ENST00000543088 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.7■■■■□ 3.95
TM7SF3-212ENST00000543088 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.67■■■■□ 3.94
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TM7SF3-212ENST00000543088 AFAP1Q8N556 730 aa39.61■■■■□ 3.93
TM7SF3-212ENST00000543088 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
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TM7SF3-212ENST00000543088 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.57■■■■□ 3.93
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TM7SF3-212ENST00000543088 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.54■■■■□ 3.92
TM7SF3-212ENST00000543088 MADDQ8WXG6 1647 aa39.51■■■■□ 3.92
TM7SF3-212ENST00000543088 MAP3K1Q13233 1512 aa39.5■■■■□ 3.91
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TM7SF3-212ENST00000543088 NCOA2Q15596 1464 aa39.49■■■■□ 3.91
TM7SF3-212ENST00000543088 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.49■■■■□ 3.91
TM7SF3-212ENST00000543088 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.48■■■■□ 3.91
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.47■■■■□ 3.91
TM7SF3-212ENST00000543088 PTPRMP28827 1452 aa39.46■■■■□ 3.91
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCA6Q8N139 1617 aa39.45■■■■□ 3.91
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TM7SF3-212ENST00000543088 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.41■■■■□ 3.9
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TM7SF3-212ENST00000543088 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.4■■■■□ 3.9
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TM7SF3-212ENST00000543088 MLECQ14165 292 aa39.35■■■■□ 3.89
TM7SF3-212ENST00000543088 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.34■■■■□ 3.89
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TM7SF3-212ENST00000543088 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
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TM7SF3-212ENST00000543088 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.14■■■■□ 3.86
TM7SF3-212ENST00000543088 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.14■■■■□ 3.86
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TM7SF3-212ENST00000543088 MIA2Q96PC5 1412 aa39.13■■■■□ 3.85
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TM7SF3-212ENST00000543088 PLXNC1O60486 1568 aa39.11■■■■□ 3.85
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TM7SF3-212ENST00000543088 TSPY10P0CW01 314 aa39■■■■□ 3.83
TM7SF3-212ENST00000543088 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.98■■■■□ 3.83
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TM7SF3-212ENST00000543088 C3P01024 1663 aa38.92■■■■□ 3.82
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TM7SF3-212ENST00000543088 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.91■■■■□ 3.82
TM7SF3-212ENST00000543088 MROH2AA6NES4 1674 aa38.9■■■■□ 3.82
TM7SF3-212ENST00000543088 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.9■■■■□ 3.82
TM7SF3-212ENST00000543088 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.87■■■■□ 3.81
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TM7SF3-212ENST00000543088 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.84■■■■□ 3.81
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TM7SF3-212ENST00000543088 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.74■■■■□ 3.79
TM7SF3-212ENST00000543088 NPATQ14207 1427 aa38.72■■■■□ 3.79
TM7SF3-212ENST00000543088 HSPA2P54652 639 aa38.72■■■■□ 3.79
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCC5O15440 1437 aa38.71■■■■□ 3.79
TM7SF3-212ENST00000543088 DAPK1P53355 1430 aa38.71■■■■□ 3.79
TM7SF3-212ENST00000543088 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
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