RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542481.1

ATG16L2-218, Transcript of autophagy related 16 like 2, humanhuman

TSL 5

Gene ATG16L2, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2-218ENST00000542481 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.47■■□□□ 1.19
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ATG16L2-218ENST00000542481 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG16L2-218ENST00000542481 PREX2Q70Z35 1606 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG16L2-218ENST00000542481 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2-218ENST00000542481 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.4■■□□□ 1.18
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ATG16L2-218ENST00000542481 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.37■■□□□ 1.17
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ATG16L2-218ENST00000542481 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.34■■□□□ 1.17
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ATG16L2-218ENST00000542481 AFAP1Q8N556 730 aa22.31■■□□□ 1.16
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ATG16L2-218ENST00000542481 TIAM1Q13009 1591 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2-218ENST00000542481 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG16L2-218ENST00000542481 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.26■■□□□ 1.15
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ATG16L2-218ENST00000542481 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
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ATG16L2-218ENST00000542481 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.2■■□□□ 1.14
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ATG16L2-218ENST00000542481 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.17■■□□□ 1.14
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ATG16L2-218ENST00000542481 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.16■■□□□ 1.14
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ATG16L2-218ENST00000542481 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.14■■□□□ 1.13
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ATG16L2-218ENST00000542481 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.85■■□□□ 1.09
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ATG16L2-218ENST00000542481 ZMYM3Q14202 1370 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2-218ENST00000542481 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2-218ENST00000542481 KIF3BO15066 747 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2-218ENST00000542481 ABCC5O15440 1437 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2-218ENST00000542481 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2-218ENST00000542481 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
ATG16L2-218ENST00000542481 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG16L2-218ENST00000542481 DAPK1P53355 1430 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2-218ENST00000542481 NPATQ14207 1427 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2-218ENST00000542481 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.74■■□□□ 1.07
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ATG16L2-218ENST00000542481 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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