RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541703.5

REXO2-211, Transcript of RNA exonuclease 2, humanhuman

TSL 3

Gene REXO2, Length 475 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2-211ENST00000541703 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
REXO2-211ENST00000541703 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.77■■■□□ 2.2
REXO2-211ENST00000541703 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.75■■■□□ 2.19
REXO2-211ENST00000541703 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.74■■■□□ 2.19
REXO2-211ENST00000541703 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.74■■■□□ 2.19
REXO2-211ENST00000541703 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.73■■■□□ 2.19
REXO2-211ENST00000541703 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
REXO2-211ENST00000541703 ABCC1P33527 1531 aa28.7■■■□□ 2.19
REXO2-211ENST00000541703 ADGRL1O94910 1474 aa28.7■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.67■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.66■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 NCOA2Q15596 1464 aa28.66■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.65■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 KDM5CP41229 1560 aa28.65■■■□□ 2.18
REXO2-211ENST00000541703 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.63■■■□□ 2.17
REXO2-211ENST00000541703 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.6■■■□□ 2.17
REXO2-211ENST00000541703 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.6■■■□□ 2.17
REXO2-211ENST00000541703 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.59■■■□□ 2.17
REXO2-211ENST00000541703 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.58■■■□□ 2.17
REXO2-211ENST00000541703 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.58■■■□□ 2.17
REXO2-211ENST00000541703 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.57■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.55■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 RAPGEF3O95398 923 aa28.55■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.54■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.53■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.52■■■□□ 2.16
REXO2-211ENST00000541703 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.5■■■□□ 2.15
REXO2-211ENST00000541703 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.46■■■□□ 2.15
REXO2-211ENST00000541703 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.46■■■□□ 2.15
REXO2-211ENST00000541703 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
REXO2-211ENST00000541703 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.45■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.44■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 MBD5Q9P267 1494 aa28.44■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 MIA2Q96PC5 1412 aa28.43■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 REREQ9P2R6 1566 aa28.43■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.43■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.43■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.43■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 APLP2Q06481 763 aa28.42■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 ABCA6Q8N139 1617 aa28.42■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.41■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.41■■■□□ 2.14
REXO2-211ENST00000541703 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.35■■■□□ 2.13
REXO2-211ENST00000541703 AFAP1Q8N556 730 aa28.35■■■□□ 2.13
REXO2-211ENST00000541703 ATP7AQ04656 1500 aa28.33■■■□□ 2.13
REXO2-211ENST00000541703 ATP10AO60312 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
REXO2-211ENST00000541703 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.32■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.32■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.32■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.32■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.29■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.28■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.28■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 PLXNC1O60486 1568 aa28.28■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 AGLP35573 1532 aa28.27■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.26■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.26■■■□□ 2.12
REXO2-211ENST00000541703 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
REXO2-211ENST00000541703 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.21■■■□□ 2.11
REXO2-211ENST00000541703 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
REXO2-211ENST00000541703 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.19■■■□□ 2.1
REXO2-211ENST00000541703 MADDQ8WXG6 1647 aa28.18■■■□□ 2.1
REXO2-211ENST00000541703 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.14■■■□□ 2.1
REXO2-211ENST00000541703 A2MP01023 1474 aa28.12■■■□□ 2.09
REXO2-211ENST00000541703 ABCC5O15440 1437 aa28.09■■■□□ 2.09
REXO2-211ENST00000541703 DAPK1P53355 1430 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO2-211ENST00000541703 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
REXO2-211ENST00000541703 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
REXO2-211ENST00000541703 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.081e-9■■■■■ 36.9
REXO2-211ENST00000541703 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
REXO2-211ENST00000541703 PTPRMP28827 1452 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO2-211ENST00000541703 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
REXO2-211ENST00000541703 ADGRL2O95490 1459 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO2-211ENST00000541703 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.01■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 TSPY4P0CV99 314 aa28■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 TSPY10P0CW01 314 aa28■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 MROH2AA6NES4 1674 aa28■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.99■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.97■■■□□ 2.07
REXO2-211ENST00000541703 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.91■■■□□ 2.06
REXO2-211ENST00000541703 C3P01024 1663 aa27.91■■■□□ 2.06
REXO2-211ENST00000541703 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.9■■■□□ 2.06
REXO2-211ENST00000541703 NCOA1Q15788 1441 aa27.9■■■□□ 2.06
REXO2-211ENST00000541703 ERBINQ96RT1 1412 aa27.9■■■□□ 2.06
REXO2-211ENST00000541703 DEPDC5O75140 1603 aa27.89■■■□□ 2.06
REXO2-211ENST00000541703 KIF15Q9NS87 1388 aa27.88■■■□□ 2.05
REXO2-211ENST00000541703 PTPRKQ15262 1439 aa27.87■■■□□ 2.05
REXO2-211ENST00000541703 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
REXO2-211ENST00000541703 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
REXO2-211ENST00000541703 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
REXO2-211ENST00000541703 MLECQ14165 292 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms