RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540080.5

CLTA-210, Transcript of clathrin light chain A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLTA, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTA-210ENST00000540080 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.37■■■■□ 3.41
CLTA-210ENST00000540080 PREX2Q70Z35 1606 aa36.36■■■■□ 3.41
CLTA-210ENST00000540080 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.35■■■■□ 3.41
CLTA-210ENST00000540080 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.34■■■■□ 3.41
CLTA-210ENST00000540080 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.33■■■■□ 3.41
CLTA-210ENST00000540080 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CLTA-210ENST00000540080 APLP2Q06481 763 aa36.3■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 RICTORQ6R327 1708 aa36.29■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.28■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 MAP3K1Q13233 1512 aa36.28■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
CLTA-210ENST00000540080 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.25■■■■□ 3.39
CLTA-210ENST00000540080 NCOA2Q15596 1464 aa36.22■■■■□ 3.39
CLTA-210ENST00000540080 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CLTA-210ENST00000540080 AFAP1Q8N556 730 aa36.19■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 ABCC1P33527 1531 aa36.17■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.16■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.16■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.15■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.15■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.14■■■■□ 3.38
CLTA-210ENST00000540080 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.12■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.11■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.1■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.1■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.1■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.09■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.08■■■■□ 3.37
CLTA-210ENST00000540080 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.06■■■■□ 3.36
CLTA-210ENST00000540080 KDM5CP41229 1560 aa36.05■■■■□ 3.36
CLTA-210ENST00000540080 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.04■■■■□ 3.36
CLTA-210ENST00000540080 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.03■■■■□ 3.36
CLTA-210ENST00000540080 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CLTA-210ENST00000540080 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.97■■■■□ 3.35
CLTA-210ENST00000540080 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.95■■■■□ 3.35
CLTA-210ENST00000540080 ATP10AO60312 1499 aa35.94■■■■□ 3.34
CLTA-210ENST00000540080 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.92■■■■□ 3.34
CLTA-210ENST00000540080 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
CLTA-210ENST00000540080 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.91■■■■□ 3.34
CLTA-210ENST00000540080 MBD5Q9P267 1494 aa35.9■■■■□ 3.34
CLTA-210ENST00000540080 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.88■■■■□ 3.33
CLTA-210ENST00000540080 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.86■■■■□ 3.33
CLTA-210ENST00000540080 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.85■■■■□ 3.33
CLTA-210ENST00000540080 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.85■■■■□ 3.33
CLTA-210ENST00000540080 MIA2Q96PC5 1412 aa35.84■■■■□ 3.33
CLTA-210ENST00000540080 ABCA6Q8N139 1617 aa35.84■■■■□ 3.33
CLTA-210ENST00000540080 MLECQ14165 292 aa35.81■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.8■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.79■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 ATP7AQ04656 1500 aa35.78■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.77■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.76■■■■□ 3.32
CLTA-210ENST00000540080 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
CLTA-210ENST00000540080 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.72■■■■□ 3.31
CLTA-210ENST00000540080 REREQ9P2R6 1566 aa35.72■■■■□ 3.31
CLTA-210ENST00000540080 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.71■■■■□ 3.31
CLTA-210ENST00000540080 TSPY4P0CV99 314 aa35.7■■■■□ 3.31
CLTA-210ENST00000540080 TSPY10P0CW01 314 aa35.7■■■■□ 3.31
CLTA-210ENST00000540080 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.69■■■■□ 3.3
CLTA-210ENST00000540080 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.69■■■■□ 3.3
CLTA-210ENST00000540080 MADDQ8WXG6 1647 aa35.68■■■■□ 3.3
CLTA-210ENST00000540080 A2MP01023 1474 aa35.63■■■■□ 3.29
CLTA-210ENST00000540080 AGLP35573 1532 aa35.62■■■■□ 3.29
CLTA-210ENST00000540080 PTPRMP28827 1452 aa35.61■■■■□ 3.29
CLTA-210ENST00000540080 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CLTA-210ENST00000540080 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CLTA-210ENST00000540080 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.57■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.56■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 ABCC5O15440 1437 aa35.55■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 PLXNC1O60486 1568 aa35.54■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.53■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.51■■■■□ 3.28
CLTA-210ENST00000540080 DAPK1P53355 1430 aa35.5■■■■□ 3.27
CLTA-210ENST00000540080 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CLTA-210ENST00000540080 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CLTA-210ENST00000540080 GGT6Q6P531 493 aa35.47■■■■□ 3.27
CLTA-210ENST00000540080 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.43■■■■□ 3.26
CLTA-210ENST00000540080 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.43■■■■□ 3.26
CLTA-210ENST00000540080 KIF3BO15066 747 aa35.43■■■■□ 3.26
CLTA-210ENST00000540080 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.43■■■■□ 3.26
CLTA-210ENST00000540080 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CLTA-210ENST00000540080 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.4■■■■□ 3.26
CLTA-210ENST00000540080 KIF15Q9NS87 1388 aa35.34■■■■□ 3.25
CLTA-210ENST00000540080 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.32■■■■□ 3.25
CLTA-210ENST00000540080 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.31■■■■□ 3.24
CLTA-210ENST00000540080 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.3■■■■□ 3.24
CLTA-210ENST00000540080 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.3■■■■□ 3.24
CLTA-210ENST00000540080 ITGAEP38570 1179 aa35.28■■■■□ 3.24
CLTA-210ENST00000540080 NCOA1Q15788 1441 aa35.26■■■■□ 3.24
CLTA-210ENST00000540080 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
CLTA-210ENST00000540080 ZMYM3Q14202 1370 aa35.25■■■■□ 3.23
CLTA-210ENST00000540080 PTPRKQ15262 1439 aa35.24■■■■□ 3.23
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