RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538725.1

MSRB3-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase B3, human

TSL 4

Gene MSRB3, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSRB3-208	ENST00000538725	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MSRB3-208	ENST00000538725	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MSRB3-208	ENST00000538725	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MSRB3-208	ENST00000538725	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MSRB3-208	ENST00000538725	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	PTPRM	P28827	1452 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MSRB3-208	ENST00000538725	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MSRB3-208	ENST00000538725	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MSRB3-208	ENST00000538725	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MSRB3-208	ENST00000538725	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MSRB3-208	ENST00000538725	ATP10A	O60312	1499 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MSRB3-208	ENST00000538725	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MSRB3-208	ENST00000538725	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MSRB3-208	ENST00000538725	MLEC	Q14165	292 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MSRB3-208	ENST00000538725	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MSRB3-208	ENST00000538725	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
MSRB3-208	ENST00000538725	KDM5C	P41229	1560 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MSRB3-208	ENST00000538725	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MSRB3-208	ENST00000538725	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MSRB3-208	ENST00000538725	ABCC1	P33527	1531 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MSRB3-208	ENST00000538725	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MSRB3-208	ENST00000538725	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MSRB3-208	ENST00000538725	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MSRB3-208	ENST00000538725	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MSRB3-208	ENST00000538725	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
MSRB3-208	ENST00000538725	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
MSRB3-208	ENST00000538725	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MSRB3-208	ENST00000538725	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	AGL	P35573	1532 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MSRB3-208	ENST00000538725	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
MSRB3-208	ENST00000538725	HSPA2	P54652	639 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MSRB3-208	ENST00000538725	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
MSRB3-208	ENST00000538725	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MSRB3-208	ENST00000538725	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
MSRB3-208	ENST00000538725	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MSRB3-208	ENST00000538725	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.19	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	C3	P01024	1663 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MSRB3-208	ENST00000538725	A2M	P01023	1474 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MSRB3-208	ENST00000538725	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MSRB3-208	ENST00000538725	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MSRB3-208	ENST00000538725	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MSRB3-208	ENST00000538725	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MSRB3-208	ENST00000538725	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MSRB3-208	ENST00000538725	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	GGT6	Q6P531	493 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MSRB3-208	ENST00000538725	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	NPAT	Q14207	1427 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MSRB3-208	ENST00000538725	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.7
MSRB3-208	ENST00000538725	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MSRB3-208	ENST00000538725	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MSRB3-208	ENST00000538725	KIF3B	O15066	747 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MSRB3-208	ENST00000538725	APLP2	Q06481	763 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MSRB3-208	ENST00000538725	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MSRB3-208	ENST00000538725	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MSRB3-208	ENST00000538725	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.84	■■■□□ 2.69
MSRB3-208	ENST00000538725	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MSRB3-208	ENST00000538725	PTPRT	O14522	1441 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MSRB3-208	ENST00000538725	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.76	■■■□□ 2.68
MSRB3-208	ENST00000538725	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.75	■■■□□ 2.67

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