RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538504.6

KLC1-211, Transcript of kinesin light chain 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLC1, Length 822 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC1-211ENST00000538504 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.5■■■■□ 3.43
KLC1-211ENST00000538504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.49■■■■□ 3.43
KLC1-211ENST00000538504 RICTORQ6R327 1708 aa36.46■■■■□ 3.43
KLC1-211ENST00000538504 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.44■■■■□ 3.42
KLC1-211ENST00000538504 PREX2Q70Z35 1606 aa36.42■■■■□ 3.42
KLC1-211ENST00000538504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
KLC1-211ENST00000538504 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.39■■■■□ 3.42
KLC1-211ENST00000538504 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
KLC1-211ENST00000538504 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.38■■■■□ 3.41
KLC1-211ENST00000538504 TIAM1Q13009 1591 aa36.37■■■■□ 3.41
KLC1-211ENST00000538504 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.35■■■■□ 3.41
KLC1-211ENST00000538504 AFAP1Q8N556 730 aa36.35■■■■□ 3.41
KLC1-211ENST00000538504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
KLC1-211ENST00000538504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.29■■■■□ 3.4
KLC1-211ENST00000538504 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
KLC1-211ENST00000538504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.26■■■■□ 3.4
KLC1-211ENST00000538504 APLP2Q06481 763 aa36.26■■■■□ 3.4
KLC1-211ENST00000538504 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.26■■■■□ 3.4
KLC1-211ENST00000538504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.25■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.24■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.24■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.24■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 ABCC1P33527 1531 aa36.24■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.24■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.23■■■■□ 3.393e-8■■■■■ 27
KLC1-211ENST00000538504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.23■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 NCOA2Q15596 1464 aa36.23■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 MAP3K1Q13233 1512 aa36.23■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.22■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.21■■■■□ 3.39
KLC1-211ENST00000538504 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.19■■■■□ 3.38
KLC1-211ENST00000538504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
KLC1-211ENST00000538504 KDM5CP41229 1560 aa36.15■■■■□ 3.38
KLC1-211ENST00000538504 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.12■■■■□ 3.37
KLC1-211ENST00000538504 ATP10AO60312 1499 aa36.11■■■■□ 3.37
KLC1-211ENST00000538504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.1■■■■□ 3.37
KLC1-211ENST00000538504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.1■■■■□ 3.37
KLC1-211ENST00000538504 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.07■■■■□ 3.37
KLC1-211ENST00000538504 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.07■■■■□ 3.37
KLC1-211ENST00000538504 MLECQ14165 292 aa36.04■■■■□ 3.36
KLC1-211ENST00000538504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.04■■■■□ 3.36
KLC1-211ENST00000538504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.03■■■■□ 3.36
KLC1-211ENST00000538504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
KLC1-211ENST00000538504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.01■■■■□ 3.36
KLC1-211ENST00000538504 ADAMTSL3P82987 1691 aa36■■■■□ 3.35
KLC1-211ENST00000538504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.99■■■■□ 3.35
KLC1-211ENST00000538504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.98■■■■□ 3.35
KLC1-211ENST00000538504 MBD5Q9P267 1494 aa35.96■■■■□ 3.35
KLC1-211ENST00000538504 ABCA6Q8N139 1617 aa35.96■■■■□ 3.35
KLC1-211ENST00000538504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.94■■■■□ 3.34
KLC1-211ENST00000538504 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.91■■■■□ 3.34
KLC1-211ENST00000538504 MADDQ8WXG6 1647 aa35.9■■■■□ 3.34
KLC1-211ENST00000538504 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.87■■■■□ 3.33
KLC1-211ENST00000538504 ATP7AQ04656 1500 aa35.87■■■■□ 3.33
KLC1-211ENST00000538504 PTPRMP28827 1452 aa35.86■■■■□ 3.33
KLC1-211ENST00000538504 MIA2Q96PC5 1412 aa35.84■■■■□ 3.33
KLC1-211ENST00000538504 REREQ9P2R6 1566 aa35.84■■■■□ 3.33
KLC1-211ENST00000538504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.81■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.81■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 TSPY4P0CV99 314 aa35.79■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 TSPY10P0CW01 314 aa35.79■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.77■■■■□ 3.32
KLC1-211ENST00000538504 AGLP35573 1532 aa35.76■■■■□ 3.31
KLC1-211ENST00000538504 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.76■■■■□ 3.31
KLC1-211ENST00000538504 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.75■■■■□ 3.31
KLC1-211ENST00000538504 A2MP01023 1474 aa35.73■■■■□ 3.31
KLC1-211ENST00000538504 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
KLC1-211ENST00000538504 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.68■■■■□ 3.3
KLC1-211ENST00000538504 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.68■■■■□ 3.3
KLC1-211ENST00000538504 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.68■■■■□ 3.3
KLC1-211ENST00000538504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
KLC1-211ENST00000538504 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
KLC1-211ENST00000538504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
KLC1-211ENST00000538504 PLXNC1O60486 1568 aa35.63■■■■□ 3.29
KLC1-211ENST00000538504 GGT6Q6P531 493 aa35.62■■■■□ 3.29
KLC1-211ENST00000538504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
KLC1-211ENST00000538504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
KLC1-211ENST00000538504 ABCC5O15440 1437 aa35.56■■■■□ 3.28
KLC1-211ENST00000538504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.55■■■■□ 3.28
KLC1-211ENST00000538504 KIF3BO15066 747 aa35.55■■■■□ 3.28
KLC1-211ENST00000538504 DAPK1P53355 1430 aa35.49■■■■□ 3.27
KLC1-211ENST00000538504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.49■■■■□ 3.27
KLC1-211ENST00000538504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
KLC1-211ENST00000538504 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.47■■■■□ 3.27
KLC1-211ENST00000538504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.46■■■■□ 3.27
KLC1-211ENST00000538504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.45■■■■□ 3.27
KLC1-211ENST00000538504 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.44■■■■□ 3.26
KLC1-211ENST00000538504 C3P01024 1663 aa35.44■■■■□ 3.26
KLC1-211ENST00000538504 ZMYM3Q14202 1370 aa35.42■■■■□ 3.26
KLC1-211ENST00000538504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.41■■■■□ 3.26
KLC1-211ENST00000538504 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
KLC1-211ENST00000538504 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
KLC1-211ENST00000538504 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.37■■■■□ 3.25
KLC1-211ENST00000538504 KIF15Q9NS87 1388 aa35.37■■■■□ 3.25
KLC1-211ENST00000538504 MROH2AA6NES4 1674 aa35.35■■■■□ 3.25
KLC1-211ENST00000538504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.35■■■■□ 3.25
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