RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534826.5

CNIH2-206, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CNIH2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2-206ENST00000534826 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.19■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.19■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.19■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.18■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.18■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.16■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.14■■■■■ 4.34
CNIH2-206ENST00000534826 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.09■■■■■ 4.33
CNIH2-206ENST00000534826 PTPRMP28827 1452 aa42.06■■■■■ 4.32
CNIH2-206ENST00000534826 MADDQ8WXG6 1647 aa42.06■■■■■ 4.32
CNIH2-206ENST00000534826 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.04■■■■■ 4.32
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CNIH2-206ENST00000534826 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.02■■■■■ 4.32
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CNIH2-206ENST00000534826 CEP162Q5TB80 1403 aa41.92■■■■■ 4.3
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CNIH2-206ENST00000534826 ATP10AO60312 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
CNIH2-206ENST00000534826 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.9■■■■■ 4.3
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CNIH2-206ENST00000534826 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.84■■■■■ 4.29
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CNIH2-206ENST00000534826 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.81■■■■■ 4.28
CNIH2-206ENST00000534826 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.78■■■■■ 4.28
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CNIH2-206ENST00000534826 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.76■■■■■ 4.27
CNIH2-206ENST00000534826 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.75■■■■■ 4.27
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CNIH2-206ENST00000534826 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.71■■■■■ 4.27
CNIH2-206ENST00000534826 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.7■■■■■ 4.27
CNIH2-206ENST00000534826 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.69■■■■■ 4.26
CNIH2-206ENST00000534826 REREQ9P2R6 1566 aa41.67■■■■■ 4.26
CNIH2-206ENST00000534826 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.66■■■■■ 4.26
CNIH2-206ENST00000534826 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
CNIH2-206ENST00000534826 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.6■■■■■ 4.25
CNIH2-206ENST00000534826 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.6■■■■■ 4.25
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CNIH2-206ENST00000534826 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.59■■■■■ 4.25
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CNIH2-206ENST00000534826 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
CNIH2-206ENST00000534826 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.54■■■■■ 4.24
CNIH2-206ENST00000534826 AGLP35573 1532 aa41.53■■■■■ 4.24
CNIH2-206ENST00000534826 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
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CNIH2-206ENST00000534826 ATP7AQ04656 1500 aa41.44■■■■■ 4.23
CNIH2-206ENST00000534826 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
CNIH2-206ENST00000534826 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
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CNIH2-206ENST00000534826 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.28■■■■■ 4.2
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CNIH2-206ENST00000534826 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.23■■■■■ 4.19
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CNIH2-206ENST00000534826 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.19■■■■■ 4.18
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CNIH2-206ENST00000534826 MROH2AA6NES4 1674 aa41.18■■■■■ 4.18
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CNIH2-206ENST00000534826 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.08■■■■■ 4.17
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CNIH2-206ENST00000534826 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.99■■■■■ 4.15
CNIH2-206ENST00000534826 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.97■■■■■ 4.15
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CNIH2-206ENST00000534826 KIF3BO15066 747 aa40.9■■■■■ 4.14
CNIH2-206ENST00000534826 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.86■■■■■ 4.13
CNIH2-206ENST00000534826 PTPRKQ15262 1439 aa40.85■■■■■ 4.13
CNIH2-206ENST00000534826 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.83■■■■■ 4.13
CNIH2-206ENST00000534826 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.82■■■■■ 4.12
CNIH2-206ENST00000534826 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.82■■■■■ 4.12
CNIH2-206ENST00000534826 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
CNIH2-206ENST00000534826 NCOA1Q15788 1441 aa40.77■■■■■ 4.12
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