RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.19■■■■■ 4.02
PTPRJ-206ENST00000534219 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.17■■■■■ 4.02
PTPRJ-206ENST00000534219 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.15■■■■■ 4.02
PTPRJ-206ENST00000534219 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.15■■■■■ 4.02
PTPRJ-206ENST00000534219 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.14■■■■■ 4.02
PTPRJ-206ENST00000534219 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.1■■■■■ 4.01
PTPRJ-206ENST00000534219 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.08■■■■■ 4.01
PTPRJ-206ENST00000534219 CEP162Q5TB80 1403 aa40.07■■■■■ 4
PTPRJ-206ENST00000534219 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.06■■■■■ 4
PTPRJ-206ENST00000534219 AFAP1Q8N556 730 aa40.05■■■■■ 4
PTPRJ-206ENST00000534219 PTPRMP28827 1452 aa40.05■■■■■ 4
PTPRJ-206ENST00000534219 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.04■■■■■ 4
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.02■■■■■ 4
PTPRJ-206ENST00000534219 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.99■■■■□ 3.99
PTPRJ-206ENST00000534219 MLECQ14165 292 aa39.98■■■■□ 3.99
PTPRJ-206ENST00000534219 PREX2Q70Z35 1606 aa39.98■■■■□ 3.99
PTPRJ-206ENST00000534219 MADDQ8WXG6 1647 aa39.97■■■■□ 3.99
PTPRJ-206ENST00000534219 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.96■■■■□ 3.99
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP10AO60312 1499 aa39.95■■■■□ 3.99
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
PTPRJ-206ENST00000534219 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.94■■■■□ 3.98
PTPRJ-206ENST00000534219 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.91■■■■□ 3.98
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM5CP41229 1560 aa39.89■■■■□ 3.98
PTPRJ-206ENST00000534219 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.88■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCC1P33527 1531 aa39.87■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.87■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.87■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.86■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.85■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.84■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
PTPRJ-206ENST00000534219 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.8■■■■□ 3.96
PTPRJ-206ENST00000534219 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.76■■■■□ 3.96
PTPRJ-206ENST00000534219 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.75■■■■□ 3.958e-7■■■■□ 23
PTPRJ-206ENST00000534219 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.73■■■■□ 3.95
PTPRJ-206ENST00000534219 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.73■■■■□ 3.95
PTPRJ-206ENST00000534219 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.71■■■■□ 3.95
PTPRJ-206ENST00000534219 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.7■■■■□ 3.95
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCA6Q8N139 1617 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.66■■■■□ 3.94
PTPRJ-206ENST00000534219 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.65■■■■□ 3.94
PTPRJ-206ENST00000534219 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.64■■■■□ 3.94
PTPRJ-206ENST00000534219 REREQ9P2R6 1566 aa39.63■■■■□ 3.93
PTPRJ-206ENST00000534219 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.62■■■■□ 3.93
PTPRJ-206ENST00000534219 TIAM1Q13009 1591 aa39.59■■■■□ 3.93
PTPRJ-206ENST00000534219 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.59■■■■□ 3.93
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
PTPRJ-206ENST00000534219 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.58■■■■□ 3.93
PTPRJ-206ENST00000534219 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
PTPRJ-206ENST00000534219 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
PTPRJ-206ENST00000534219 AGLP35573 1532 aa39.54■■■■□ 3.92
PTPRJ-206ENST00000534219 NCOA2Q15596 1464 aa39.51■■■■□ 3.92
PTPRJ-206ENST00000534219 HSPA2P54652 639 aa39.49■■■■□ 3.91
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP7AQ04656 1500 aa39.47■■■■□ 3.91
PTPRJ-206ENST00000534219 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.42■■■■□ 3.9
PTPRJ-206ENST00000534219 MBD5Q9P267 1494 aa39.41■■■■□ 3.9
PTPRJ-206ENST00000534219 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
PTPRJ-206ENST00000534219 A2MP01023 1474 aa39.37■■■■□ 3.89
PTPRJ-206ENST00000534219 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.33■■■■□ 3.89
PTPRJ-206ENST00000534219 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.31■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 MAP3K1Q13233 1512 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 APLP2Q06481 763 aa39.29■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 GGT6Q6P531 493 aa39.29■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.29■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.28■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 PLXNC1O60486 1568 aa39.26■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.26■■■■□ 3.88
PTPRJ-206ENST00000534219 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.25■■■■□ 3.87
PTPRJ-206ENST00000534219 C3P01024 1663 aa39.24■■■■□ 3.87
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPY4P0CV99 314 aa39.21■■■■□ 3.87
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPY10P0CW01 314 aa39.21■■■■□ 3.87
PTPRJ-206ENST00000534219 ZMYM3Q14202 1370 aa39.2■■■■□ 3.87
PTPRJ-206ENST00000534219 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.19■■■■□ 3.86
PTPRJ-206ENST00000534219 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
PTPRJ-206ENST00000534219 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.13■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 FBXO41Q8TF61 875 aa39.12■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.12■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.12■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 KIF3BO15066 747 aa39.1■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 MIA2Q96PC5 1412 aa39.09■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 MROH2AA6NES4 1674 aa39.09■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
PTPRJ-206ENST00000534219 NPATQ14207 1427 aa39.06■■■■□ 3.84
PTPRJ-206ENST00000534219 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.02■■■■□ 3.84
PTPRJ-206ENST00000534219 PTPRKQ15262 1439 aa38.96■■■■□ 3.83
PTPRJ-206ENST00000534219 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.93■■■■□ 3.82
PTPRJ-206ENST00000534219 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.91■■■■□ 3.82
PTPRJ-206ENST00000534219 STRCQ7RTU9 1775 aa38.89■■■■□ 3.82
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.85■■■■□ 3.81
PTPRJ-206ENST00000534219 CERKQ8TCT0 537 aa38.84■■■■□ 3.81
PTPRJ-206ENST00000534219 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.83■■■■□ 3.81
PTPRJ-206ENST00000534219 NCOA1Q15788 1441 aa38.82■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms