RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533337.1

ROBO4-209, Transcript of roundabout guidance receptor 4, human

TSL 2

Gene ROBO4, Length 633 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROBO4-209	ENST00000533337	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.16	■■■■□ 3.06
ROBO4-209	ENST00000533337	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.14	■■■■□ 3.06
ROBO4-209	ENST00000533337	APLP2	Q06481	763 aa		34.14	■■■■□ 3.06
ROBO4-209	ENST00000533337	ADGRL1	O94910	1474 aa		34.14	■■■■□ 3.06
ROBO4-209	ENST00000533337	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		34.13	■■■■□ 3.05
ROBO4-209	ENST00000533337	RAPGEF3	O95398	923 aa		34.13	■■■■□ 3.05
ROBO4-209	ENST00000533337	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.13	■■■■□ 3.05
ROBO4-209	ENST00000533337	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.11	■■■■□ 3.05
ROBO4-209	ENST00000533337	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
ROBO4-209	ENST00000533337	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		34.07	■■■■□ 3.05
ROBO4-209	ENST00000533337	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
ROBO4-209	ENST00000533337	NCOA2	Q15596	1464 aa		34.07	■■■■□ 3.04
ROBO4-209	ENST00000533337	RICTOR	Q6R327	1708 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ROBO4-209	ENST00000533337	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	34.04	■■■■□ 3.04
ROBO4-209	ENST00000533337	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ROBO4-209	ENST00000533337	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.99	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	ABCC1	P33527	1531 aa		33.99	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.98	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.97	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ROBO4-209	ENST00000533337	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
ROBO4-209	ENST00000533337	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ROBO4-209	ENST00000533337	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ROBO4-209	ENST00000533337	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ROBO4-209	ENST00000533337	KDM5C	P41229	1560 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ROBO4-209	ENST00000533337	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.83	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.82	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3.01
ROBO4-209	ENST00000533337	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.82	■■■■□ 3
ROBO4-209	ENST00000533337	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.82	■■■■□ 3
ROBO4-209	ENST00000533337	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.8	■■■■□ 3
ROBO4-209	ENST00000533337	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.78	■■■■□ 3
ROBO4-209	ENST00000533337	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.77	■■■■□ 3
ROBO4-209	ENST00000533337	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.76	■■■□□ 2.99
ROBO4-209	ENST00000533337	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.76	■■■□□ 2.99
ROBO4-209	ENST00000533337	ATP10A	O60312	1499 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ROBO4-209	ENST00000533337	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ROBO4-209	ENST00000533337	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
ROBO4-209	ENST00000533337	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.68	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ROBO4-209	ENST00000533337	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ROBO4-209	ENST00000533337	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	AGL	P35573	1532 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ROBO4-209	ENST00000533337	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ROBO4-209	ENST00000533337	A2M	P01023	1474 aa		33.46	■■■□□ 2.95
ROBO4-209	ENST00000533337	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	ABCC5	O15440	1437 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	DAPK1	P53355	1430 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
ROBO4-209	ENST00000533337	MLEC	Q14165	292 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ROBO4-209	ENST00000533337	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ROBO4-209	ENST00000533337	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
ROBO4-209	ENST00000533337	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.34	■■■□□ 2.93
ROBO4-209	ENST00000533337	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ROBO4-209	ENST00000533337	PTPRM	P28827	1452 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ROBO4-209	ENST00000533337	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	KIF3B	O15066	747 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
ROBO4-209	ENST00000533337	GGT6	Q6P531	493 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ROBO4-209	ENST00000533337	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ROBO4-209	ENST00000533337	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ROBO4-209	ENST00000533337	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
ROBO4-209	ENST00000533337	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ROBO4-209	ENST00000533337	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.14	■■■□□ 2.9

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