RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533007.1

SLC6A9-211, Transcript of solute carrier family 6 member 9, humanhuman

TSL 4

Gene SLC6A9, Length 508 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9-211ENST00000533007 PREX2Q70Z35 1606 aa36.19■■■■□ 3.38
SLC6A9-211ENST00000533007 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.19■■■■□ 3.38
SLC6A9-211ENST00000533007 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC6A9-211ENST00000533007 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.15■■■■□ 3.38
SLC6A9-211ENST00000533007 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.14■■■■□ 3.38
SLC6A9-211ENST00000533007 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.13■■■■□ 3.38
SLC6A9-211ENST00000533007 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC6A9-211ENST00000533007 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC6A9-211ENST00000533007 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.09■■■■□ 3.37
SLC6A9-211ENST00000533007 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.07■■■■□ 3.36
SLC6A9-211ENST00000533007 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC6A9-211ENST00000533007 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC6A9-211ENST00000533007 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCC1P33527 1531 aa36.01■■■■□ 3.36
SLC6A9-211ENST00000533007 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36■■■■□ 3.35
SLC6A9-211ENST00000533007 KDM5CP41229 1560 aa35.98■■■■□ 3.35
SLC6A9-211ENST00000533007 TIAM1Q13009 1591 aa35.98■■■■□ 3.35
SLC6A9-211ENST00000533007 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.97■■■■□ 3.35
SLC6A9-211ENST00000533007 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.97■■■■□ 3.35
SLC6A9-211ENST00000533007 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 AFAP1Q8N556 730 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
SLC6A9-211ENST00000533007 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 MAP3K1Q13233 1512 aa35.87■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 ATP10AO60312 1499 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC6A9-211ENST00000533007 NCOA2Q15596 1464 aa35.82■■■■□ 3.32
SLC6A9-211ENST00000533007 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.82■■■■□ 3.32
SLC6A9-211ENST00000533007 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.81■■■■□ 3.32
SLC6A9-211ENST00000533007 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC6A9-211ENST00000533007 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC6A9-211ENST00000533007 MADDQ8WXG6 1647 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCA6Q8N139 1617 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC6A9-211ENST00000533007 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.74■■■■□ 3.31
SLC6A9-211ENST00000533007 REREQ9P2R6 1566 aa35.74■■■■□ 3.31
SLC6A9-211ENST00000533007 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
SLC6A9-211ENST00000533007 PTPRMP28827 1452 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC6A9-211ENST00000533007 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC6A9-211ENST00000533007 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
SLC6A9-211ENST00000533007 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
SLC6A9-211ENST00000533007 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
SLC6A9-211ENST00000533007 APLP2Q06481 763 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 MLECQ14165 292 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 MBD5Q9P267 1494 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 ATP7AQ04656 1500 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 AGLP35573 1532 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.6■■■■□ 3.29
SLC6A9-211ENST00000533007 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.51■■■■□ 3.28
SLC6A9-211ENST00000533007 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.49■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 MIA2Q96PC5 1412 aa35.49■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.48■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 A2MP01023 1474 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 PLXNC1O60486 1568 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC6A9-211ENST00000533007 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.36■■■■□ 3.25
SLC6A9-211ENST00000533007 TSPY4P0CV99 314 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC6A9-211ENST00000533007 TSPY10P0CW01 314 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC6A9-211ENST00000533007 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
SLC6A9-211ENST00000533007 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.32■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.3■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 C3P01024 1663 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.26■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
SLC6A9-211ENST00000533007 MROH2AA6NES4 1674 aa35.24■■■■□ 3.23
SLC6A9-211ENST00000533007 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
SLC6A9-211ENST00000533007 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
SLC6A9-211ENST00000533007 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC6A9-211ENST00000533007 GGT6Q6P531 493 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.17■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCC5O15440 1437 aa35.14■■■■□ 3.22
SLC6A9-211ENST00000533007 KIF3BO15066 747 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC6A9-211ENST00000533007 ZMYM3Q14202 1370 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC6A9-211ENST00000533007 DAPK1P53355 1430 aa35.1■■■■□ 3.21
SLC6A9-211ENST00000533007 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.09■■■■□ 3.21
SLC6A9-211ENST00000533007 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.08■■■■□ 3.21
SLC6A9-211ENST00000533007 HSPA2P54652 639 aa35.07■■■■□ 3.2
SLC6A9-211ENST00000533007 NPATQ14207 1427 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC6A9-211ENST00000533007 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
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