RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ADGRL1O94910 1474 aa34.68■■■■□ 3.14
PTPRK-222ENST00000532751 RAPGEF3O95398 923 aa34.67■■■■□ 3.14
PTPRK-222ENST00000532751 RICTORQ6R327 1708 aa34.65■■■■□ 3.14
PTPRK-222ENST00000532751 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.64■■■■□ 3.14
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K1Q13233 1512 aa34.63■■■■□ 3.13
PTPRK-222ENST00000532751 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.62■■■■□ 3.13
PTPRK-222ENST00000532751 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
PTPRK-222ENST00000532751 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.6■■■■□ 3.13
PTPRK-222ENST00000532751 APLP2Q06481 763 aa34.58■■■■□ 3.13
PTPRK-222ENST00000532751 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
PTPRK-222ENST00000532751 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPRK-222ENST00000532751 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.54■■■■□ 3.12
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.51■■■■□ 3.12
PTPRK-222ENST00000532751 NCOA2Q15596 1464 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC1P33527 1531 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.47■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.46■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.45■■■■□ 3.11
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.45■■■■□ 3.1
PTPRK-222ENST00000532751 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
PTPRK-222ENST00000532751 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.42■■■■□ 3.1
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.41■■■■□ 3.1
PTPRK-222ENST00000532751 KDM5CP41229 1560 aa34.4■■■■□ 3.1
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.4■■■■□ 3.1
PTPRK-222ENST00000532751 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 AFAP1Q8N556 730 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.36■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.34■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.082e-6■■■□□ 16.2
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PTPRK-222ENST00000532751 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 ATP10AO60312 1499 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.23■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.21■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.21■■■■□ 3.07
PTPRK-222ENST00000532751 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 MIA2Q96PC5 1412 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 ABCA6Q8N139 1617 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.18■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 MBD5Q9P267 1494 aa34.17■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPRK-222ENST00000532751 ATP7AQ04656 1500 aa34.13■■■■□ 3.05
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPRK-222ENST00000532751 REREQ9P2R6 1566 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPRK-222ENST00000532751 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPRK-222ENST00000532751 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPRK-222ENST00000532751 MADDQ8WXG6 1647 aa34.03■■■■□ 3.04
PTPRK-222ENST00000532751 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPRK-222ENST00000532751 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.01■■■■□ 3.04
PTPRK-222ENST00000532751 MLECQ14165 292 aa34.01■■■■□ 3.03
PTPRK-222ENST00000532751 TSPY4P0CV99 314 aa34■■■■□ 3.03
PTPRK-222ENST00000532751 TSPY10P0CW01 314 aa34■■■■□ 3.03
PTPRK-222ENST00000532751 AGLP35573 1532 aa33.99■■■■□ 3.03
PTPRK-222ENST00000532751 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPRK-222ENST00000532751 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
PTPRK-222ENST00000532751 A2MP01023 1474 aa33.95■■■■□ 3.02
PTPRK-222ENST00000532751 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.02
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRMP28827 1452 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPRK-222ENST00000532751 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPRK-222ENST00000532751 PLXNC1O60486 1568 aa33.9■■■■□ 3.02
PTPRK-222ENST00000532751 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.87■■■■□ 3.01
PTPRK-222ENST00000532751 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
PTPRK-222ENST00000532751 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
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PTPRK-222ENST00000532751 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.82■■■■□ 3.01
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC5O15440 1437 aa33.81■■■■□ 3
PTPRK-222ENST00000532751 DAPK1P53355 1430 aa33.81■■■■□ 3
PTPRK-222ENST00000532751 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PTPRK-222ENST00000532751 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PTPRK-222ENST00000532751 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.72■■■□□ 2.99
PTPRK-222ENST00000532751 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.71■■■□□ 2.99
PTPRK-222ENST00000532751 GGT6Q6P531 493 aa33.71■■■□□ 2.99
PTPRK-222ENST00000532751 KIF3BO15066 747 aa33.69■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.68■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.67■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 MROH2AA6NES4 1674 aa33.66■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.65■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 KIF15Q9NS87 1388 aa33.65■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.65■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 C3P01024 1663 aa33.64■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
PTPRK-222ENST00000532751 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.61■■■□□ 2.97
PTPRK-222ENST00000532751 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.6■■■□□ 2.97
PTPRK-222ENST00000532751 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
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