RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 PLCH2O75038 1416 aa24.92■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.91■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.91■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 KIF14Q15058 1648 aa24.9■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.9■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.89■■□□□ 1.58
BRPF3-210ENST00000532538 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.88■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 CLIP1P30622 1438 aa24.87■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.87■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.86■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.85■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.84■■□□□ 1.57
BRPF3-210ENST00000532538 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
BRPF3-210ENST00000532538 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.79■■□□□ 1.56
BRPF3-210ENST00000532538 ATP10AO60312 1499 aa24.77■■□□□ 1.56
BRPF3-210ENST00000532538 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.77■■□□□ 1.56
BRPF3-210ENST00000532538 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.76■■□□□ 1.55
BRPF3-210ENST00000532538 HSPA2P54652 639 aa24.76■■□□□ 1.55
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.75■■□□□ 1.55
BRPF3-210ENST00000532538 AFAP1Q8N556 730 aa24.73■■□□□ 1.55
BRPF3-210ENST00000532538 FBXO41Q8TF61 875 aa24.73■■□□□ 1.55
BRPF3-210ENST00000532538 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.72■■□□□ 1.55
BRPF3-210ENST00000532538 PREX2Q70Z35 1606 aa24.69■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.69■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 KDM5CP41229 1560 aa24.66■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.66■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.65■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.65■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
BRPF3-210ENST00000532538 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.64■■□□□ 1.53
BRPF3-210ENST00000532538 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.63■■□□□ 1.53
BRPF3-210ENST00000532538 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.61■■□□□ 1.53
BRPF3-210ENST00000532538 ABCA6Q8N139 1617 aa24.61■■□□□ 1.53
BRPF3-210ENST00000532538 ABCC1P33527 1531 aa24.6■■□□□ 1.53
BRPF3-210ENST00000532538 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
BRPF3-210ENST00000532538 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.57■■□□□ 1.52
BRPF3-210ENST00000532538 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.56■■□□□ 1.52
BRPF3-210ENST00000532538 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.53■■□□□ 1.52
BRPF3-210ENST00000532538 REREQ9P2R6 1566 aa24.53■■□□□ 1.52
BRPF3-210ENST00000532538 C3P01024 1663 aa24.52■■□□□ 1.52
BRPF3-210ENST00000532538 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.52■■□□□ 1.52
BRPF3-210ENST00000532538 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.49■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.48■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.47■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 CERKQ8TCT0 537 aa24.47■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 AGLP35573 1532 aa24.46■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.46■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
BRPF3-210ENST00000532538 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.45■■□□□ 1.5
BRPF3-210ENST00000532538 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
BRPF3-210ENST00000532538 STRCQ7RTU9 1775 aa24.44■■□□□ 1.5
BRPF3-210ENST00000532538 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.4■■□□□ 1.5
BRPF3-210ENST00000532538 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.39■■□□□ 1.5
BRPF3-210ENST00000532538 ATP7AQ04656 1500 aa24.38■■□□□ 1.49
BRPF3-210ENST00000532538 MROH2AA6NES4 1674 aa24.35■■□□□ 1.49
BRPF3-210ENST00000532538 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
BRPF3-210ENST00000532538 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.33■■□□□ 1.49
BRPF3-210ENST00000532538 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.32■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 GGT6Q6P531 493 aa24.32■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 A2MP01023 1474 aa24.31■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.3■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 ZMYM3Q14202 1370 aa24.29■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 TIAM1Q13009 1591 aa24.29■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 CEP162Q5TB80 1403 aa24.28■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
BRPF3-210ENST00000532538 PTPRTO14522 1441 aa24.25■■□□□ 1.47
BRPF3-210ENST00000532538 NPATQ14207 1427 aa24.24■■□□□ 1.47
BRPF3-210ENST00000532538 PLXNC1O60486 1568 aa24.24■■□□□ 1.47
BRPF3-210ENST00000532538 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.24■■□□□ 1.47
BRPF3-210ENST00000532538 NCOA1Q15788 1441 aa24.2■■□□□ 1.46
BRPF3-210ENST00000532538 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.19■■□□□ 1.46
BRPF3-210ENST00000532538 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.16■■□□□ 1.46
BRPF3-210ENST00000532538 NCOA2Q15596 1464 aa24.15■■□□□ 1.46
BRPF3-210ENST00000532538 MBD5Q9P267 1494 aa24.15■■□□□ 1.46
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BRPF3-210ENST00000532538 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.13■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 KIF3BO15066 747 aa24.13■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.13■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 PTPRKQ15262 1439 aa24.12■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.1■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 TSPY4P0CV99 314 aa24.09■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 TSPY10P0CW01 314 aa24.09■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.09■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 PKD2Q13563 968 aa24.08■■□□□ 1.45
BRPF3-210ENST00000532538 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.07■■□□□ 1.44
BRPF3-210ENST00000532538 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.06■■□□□ 1.44
BRPF3-210ENST00000532538 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.05■■□□□ 1.44
BRPF3-210ENST00000532538 PLA2R1Q13018 1463 aa24.04■■□□□ 1.44
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
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