RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.49■■■■□ 3.43
ME3-210ENST00000532471 RICTORQ6R327 1708 aa36.48■■■■□ 3.43
ME3-210ENST00000532471 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.46■■■■□ 3.43
ME3-210ENST00000532471 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
ME3-210ENST00000532471 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.44■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.44■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.42■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.42■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 PREX2Q70Z35 1606 aa36.41■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 AFAP1Q8N556 730 aa36.4■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.39■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
ME3-210ENST00000532471 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.37■■■■□ 3.41
ME3-210ENST00000532471 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.37■■■■□ 3.41
ME3-210ENST00000532471 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.36■■■■□ 3.41
ME3-210ENST00000532471 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.35■■■■□ 3.41
ME3-210ENST00000532471 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.33■■■■□ 3.41
ME3-210ENST00000532471 APLP2Q06481 763 aa36.32■■■■□ 3.4
ME3-210ENST00000532471 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.31■■■■□ 3.4
ME3-210ENST00000532471 TIAM1Q13009 1591 aa36.28■■■■□ 3.4
ME3-210ENST00000532471 ABCC1P33527 1531 aa36.26■■■■□ 3.4
ME3-210ENST00000532471 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.25■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 ATP10AO60312 1499 aa36.24■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.24■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.24■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.23■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 MAP3K1Q13233 1512 aa36.21■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 KDM5CP41229 1560 aa36.2■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.2■■■■□ 3.39
ME3-210ENST00000532471 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.19■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 NCOA2Q15596 1464 aa36.18■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.18■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.18■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.17■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.16■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 MLECQ14165 292 aa36.14■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.14■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.14■■■■□ 3.38
ME3-210ENST00000532471 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
ME3-210ENST00000532471 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.12■■■■□ 3.37
ME3-210ENST00000532471 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.11■■■■□ 3.37
ME3-210ENST00000532471 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.05■■■■□ 3.36
ME3-210ENST00000532471 PTPRMP28827 1452 aa36.04■■■■□ 3.36
ME3-210ENST00000532471 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.01■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 MADDQ8WXG6 1647 aa35.99■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.97■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.97■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 MBD5Q9P267 1494 aa35.96■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 REREQ9P2R6 1566 aa35.96■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 ABCA6Q8N139 1617 aa35.96■■■■□ 3.35
ME3-210ENST00000532471 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.92■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 TSPY4P0CV99 314 aa35.92■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 TSPY10P0CW01 314 aa35.92■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
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ME3-210ENST00000532471 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.9■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 AGLP35573 1532 aa35.89■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.89■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 MIA2Q96PC5 1412 aa35.89■■■■□ 3.34
ME3-210ENST00000532471 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.87■■■■□ 3.33
ME3-210ENST00000532471 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.86■■■■□ 3.33
ME3-210ENST00000532471 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
ME3-210ENST00000532471 A2MP01023 1474 aa35.81■■■■□ 3.32
ME3-210ENST00000532471 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.81■■■■□ 3.32
ME3-210ENST00000532471 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.76■■■■□ 3.32
ME3-210ENST00000532471 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
ME3-210ENST00000532471 GGT6Q6P531 493 aa35.72■■■■□ 3.31
ME3-210ENST00000532471 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
ME3-210ENST00000532471 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.71■■■■□ 3.31
ME3-210ENST00000532471 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.69■■■■□ 3.3
ME3-210ENST00000532471 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.68■■■■□ 3.3
ME3-210ENST00000532471 PLXNC1O60486 1568 aa35.66■■■■□ 3.3
ME3-210ENST00000532471 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.65■■■■□ 3.3
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ME3-210ENST00000532471 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.61■■■■□ 3.29
ME3-210ENST00000532471 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.55■■■■□ 3.28
ME3-210ENST00000532471 ZMYM3Q14202 1370 aa35.55■■■■□ 3.28
ME3-210ENST00000532471 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.54■■■■□ 3.28
ME3-210ENST00000532471 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
ME3-210ENST00000532471 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
ME3-210ENST00000532471 ABCC5O15440 1437 aa35.52■■■■□ 3.28
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ME3-210ENST00000532471 HSPA2P54652 639 aa35.48■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 C3P01024 1663 aa35.48■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 DAPK1P53355 1430 aa35.48■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.46■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.46■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.45■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.45■■■■□ 3.27
ME3-210ENST00000532471 MROH2AA6NES4 1674 aa35.44■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.43■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
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