RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531448.5

DEUP1-208, Transcript of deuterosome assembly protein 1, human

TSL 5

Gene DEUP1, Length 2,784 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DEUP1-208	ENST00000531448	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.32	■■■□□ 2.92
DEUP1-208	ENST00000531448	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		33.32	■■■□□ 2.92
DEUP1-208	ENST00000531448	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
DEUP1-208	ENST00000531448	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
DEUP1-208	ENST00000531448	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		33.3	■■■□□ 2.92
DEUP1-208	ENST00000531448	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.29	■■■□□ 2.92
DEUP1-208	ENST00000531448	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.26	■■■□□ 2.91
DEUP1-208	ENST00000531448	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		33.24	■■■□□ 2.91
DEUP1-208	ENST00000531448	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.24	■■■□□ 2.91
DEUP1-208	ENST00000531448	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.24	■■■□□ 2.91
DEUP1-208	ENST00000531448	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.23	■■■□□ 2.91
DEUP1-208	ENST00000531448	NUP160	Q12769	1436 aa		33.17	■■■□□ 2.9
DEUP1-208	ENST00000531448	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.16	■■■□□ 2.9
DEUP1-208	ENST00000531448	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
DEUP1-208	ENST00000531448	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.14	■■■□□ 2.9
DEUP1-208	ENST00000531448	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.09	■■■□□ 2.89
DEUP1-208	ENST00000531448	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.07	■■■□□ 2.88
DEUP1-208	ENST00000531448	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.04	■■■□□ 2.88
DEUP1-208	ENST00000531448	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.04	■■■□□ 2.88
DEUP1-208	ENST00000531448	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
DEUP1-208	ENST00000531448	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
DEUP1-208	ENST00000531448	NAIP	Q13075	1403 aa		33.02	■■■□□ 2.88
DEUP1-208	ENST00000531448	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
DEUP1-208	ENST00000531448	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.01	■■■□□ 2.87
DEUP1-208	ENST00000531448	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.99	■■■□□ 2.87
DEUP1-208	ENST00000531448	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
DEUP1-208	ENST00000531448	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
DEUP1-208	ENST00000531448	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.96	■■■□□ 2.87
DEUP1-208	ENST00000531448	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
DEUP1-208	ENST00000531448	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.89	■■■□□ 2.86
DEUP1-208	ENST00000531448	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
DEUP1-208	ENST00000531448	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
DEUP1-208	ENST00000531448	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
DEUP1-208	ENST00000531448	NEFM	P07197	916 aa		32.78	■■■□□ 2.84
DEUP1-208	ENST00000531448	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		32.78	■■■□□ 2.84
DEUP1-208	ENST00000531448	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.77	■■■□□ 2.84
DEUP1-208	ENST00000531448	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.84
DEUP1-208	ENST00000531448	ABCA8	O94911	1581 aa		32.76	■■■□□ 2.84
DEUP1-208	ENST00000531448	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.76	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.75	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	DAPK1	P53355	1430 aa		32.75	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.75	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	CHD1	O14646	1710 aa		32.74	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	ABCC5	O15440	1437 aa		32.72	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.72	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.72	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	KIF14	Q15058	1648 aa		32.72	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	KDM6B	O15054	1643 aa		32.71	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	ATP10B	O94823	1461 aa		32.71	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.7	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	PTPRG	P23470	1445 aa		32.7	■■■□□ 2.83
DEUP1-208	ENST00000531448	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
DEUP1-208	ENST00000531448	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
DEUP1-208	ENST00000531448	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
DEUP1-208	ENST00000531448	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.64	■■■□□ 2.82
DEUP1-208	ENST00000531448	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.64	■■■□□ 2.81
DEUP1-208	ENST00000531448	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.63	■■■□□ 2.81
DEUP1-208	ENST00000531448	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.62	■■■□□ 2.81
DEUP1-208	ENST00000531448	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
DEUP1-208	ENST00000531448	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.58	■■■□□ 2.81
DEUP1-208	ENST00000531448	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.57	■■■□□ 2.8
DEUP1-208	ENST00000531448	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
DEUP1-208	ENST00000531448	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		32.56	■■■□□ 2.8
DEUP1-208	ENST00000531448	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.54	■■■□□ 2.8
DEUP1-208	ENST00000531448	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.52	■■■□□ 2.8
DEUP1-208	ENST00000531448	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.51	■■■□□ 2.79
DEUP1-208	ENST00000531448	FOXD1	Q16676	465 aa		32.49	■■■□□ 2.79
DEUP1-208	ENST00000531448	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.49	■■■□□ 2.79
DEUP1-208	ENST00000531448	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.47	■■■□□ 2.79
DEUP1-208	ENST00000531448	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.45	■■■□□ 2.79
DEUP1-208	ENST00000531448	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.45	■■■□□ 2.79
DEUP1-208	ENST00000531448	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.45	■■■□□ 2.78
DEUP1-208	ENST00000531448	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.44	■■■□□ 2.78
DEUP1-208	ENST00000531448	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.42	■■■□□ 2.78
DEUP1-208	ENST00000531448	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DEUP1-208	ENST00000531448	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
DEUP1-208	ENST00000531448	GSE1	Q14687	1217 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DEUP1-208	ENST00000531448	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DEUP1-208	ENST00000531448	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DEUP1-208	ENST00000531448	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DEUP1-208	ENST00000531448	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.31	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.3	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.29	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.27	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.27	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.27	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
DEUP1-208	ENST00000531448	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.25	■■■□□ 2.75
DEUP1-208	ENST00000531448	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
DEUP1-208	ENST00000531448	PZP	P20742	1482 aa		32.25	■■■□□ 2.75
DEUP1-208	ENST00000531448	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.25	■■■□□ 2.75
DEUP1-208	ENST00000531448	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.22	■■■□□ 2.75
DEUP1-208	ENST00000531448	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.21	■■■□□ 2.75
DEUP1-208	ENST00000531448	PDE4A	P27815	886 aa		32.2	■■■□□ 2.75

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