RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.13■■■□□ 2.41
PACSIN3-208ENST00000531226 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRL1O94910 1474 aa30.07■■■□□ 2.4
PACSIN3-208ENST00000531226 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.07■■■□□ 2.4
PACSIN3-208ENST00000531226 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-208ENST00000531226 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-208ENST00000531226 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.04■■■□□ 2.4
PACSIN3-208ENST00000531226 RAPGEF3O95398 923 aa30.01■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 SCAPERQ9BY12 1400 aa30■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC1P33527 1531 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 NCOA2Q15596 1464 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-208ENST00000531226 APLP2Q06481 763 aa29.92■■■□□ 2.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.91■■■□□ 2.38
PACSIN3-208ENST00000531226 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PACSIN3-208ENST00000531226 KDM5CP41229 1560 aa29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-208ENST00000531226 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.81■■■□□ 2.36
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.8■■■□□ 2.36
PACSIN3-208ENST00000531226 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.79■■■□□ 2.36
PACSIN3-208ENST00000531226 AFAP1Q8N556 730 aa29.77■■■□□ 2.36
PACSIN3-208ENST00000531226 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.75■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.74■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.74■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.74■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.73■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCA6Q8N139 1617 aa29.72■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.72■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MBD5Q9P267 1494 aa29.69■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 MIA2Q96PC5 1412 aa29.69■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.68■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.68■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP10AO60312 1499 aa29.68■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.66■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.65■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP7AQ04656 1500 aa29.65■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 REREQ9P2R6 1566 aa29.64■■■□□ 2.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.63■■■□□ 2.33
PACSIN3-208ENST00000531226 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.63■■■□□ 2.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.62■■■□□ 2.33
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.62■■■□□ 2.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
PACSIN3-208ENST00000531226 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.56■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.56■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.55■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 MADDQ8WXG6 1647 aa29.53■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.53■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.53■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 AGLP35573 1532 aa29.51■■■□□ 2.32
PACSIN3-208ENST00000531226 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.51■■■□□ 2.31
PACSIN3-208ENST00000531226 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.51■■■□□ 2.31
PACSIN3-208ENST00000531226 PLXNC1O60486 1568 aa29.49■■■□□ 2.31
PACSIN3-208ENST00000531226 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PACSIN3-208ENST00000531226 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PACSIN3-208ENST00000531226 A2MP01023 1474 aa29.45■■■□□ 2.31
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPY4P0CV99 314 aa29.41■■■□□ 2.3
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPY10P0CW01 314 aa29.41■■■□□ 2.3
PACSIN3-208ENST00000531226 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.4■■■□□ 2.3
PACSIN3-208ENST00000531226 MLECQ14165 292 aa29.39■■■□□ 2.3
PACSIN3-208ENST00000531226 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PACSIN3-208ENST00000531226 DAPK1P53355 1430 aa29.38■■■□□ 2.29
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRMP28827 1452 aa29.38■■■□□ 2.29
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC5O15440 1437 aa29.37■■■□□ 2.29
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PACSIN3-208ENST00000531226 MROH2AA6NES4 1674 aa29.25■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.25■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 C3P01024 1663 aa29.23■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRL2O95490 1459 aa29.21■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.2■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF15Q9NS87 1388 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF3BO15066 747 aa29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 GGT6Q6P531 493 aa29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-208ENST00000531226 NCOA1Q15788 1441 aa29.15■■■□□ 2.26
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