RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf72A6NCS6 295 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-214ENST00000530727 PLCB2Q00722 1185 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-214ENST00000530727 KIF3CO14782 793 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-214ENST00000530727 SNPHO15079 494 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 PDE4AP27815 886 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 FOXK1P85037 733 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 DSG2Q14126 1118 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 DOK7Q18PE1 504 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-214ENST00000530727 PLPP6Q8IY26 295 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 RIMBP2O15034 1052 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 MFSD10Q14728 455 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 ST18O60284 1047 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-214ENST00000530727 WDR70Q9NW82 654 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 SLC24A1O60721 1099 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 SLC34A2O95436 690 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 ARSIQ5FYB1 569 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 GPR153Q6NV75 609 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-214ENST00000530727 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 MARVELD3Q96A59 401 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D12O60347 775 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 EMP3P54852 163 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 OXER1Q8TDS5 423 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.965e-7■■□□□ 12.4
PTPRC-214ENST00000530727 CAMK2BQ13554 666 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 E2F4Q16254 413 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 NUDT7P0C024 238 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 POTEMA6NI47 508 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K9P80192 1104 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 POTEGQ6S5H5 508 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-214ENST00000530727 ERBB3P21860 1342 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 FAM205CA6NFA0 338 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 DPYSL4O14531 572 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 EVI5O60447 810 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 P3H3Q8IVL6 736 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 LHX6Q9UPM6 363 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-214ENST00000530727 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 POTEB3A0JP26 581 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 POTEBQ6S5H4 581 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 PDIA6Q15084 440 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-214ENST00000530727 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 JPH4Q96JJ6 628 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 FOSBP53539 338 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 DDX12PQ92771 950 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 PHF14O94880 888 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 PTGER2P43116 358 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-214ENST00000530727 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 NBR1Q14596 966 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 EPAS1Q99814 870 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 PBX2P40425 430 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 FBXW7Q969H0 707 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 KCNH8Q96L42 1107 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP33O14559 1287 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 SEMA3EO15041 775 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 KCNK17Q96T54 332 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-214ENST00000530727 PTPREP23469 700 aa8.78□□□□□ -1
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