RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.11■■■□□ 2.41
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TSTA3-211ENST00000529899 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.04■■■□□ 2.4
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TSTA3-211ENST00000529899 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.01■■■□□ 2.39
TSTA3-211ENST00000529899 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30■■■□□ 2.39
TSTA3-211ENST00000529899 MTUS2Q5JR59 1369 aa30■■■□□ 2.39
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TSTA3-211ENST00000529899 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.79■■■□□ 2.36
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TSTA3-211ENST00000529899 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
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TSTA3-211ENST00000529899 PTPRMP28827 1452 aa29.68■■■□□ 2.34
TSTA3-211ENST00000529899 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.67■■■□□ 2.34
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TSTA3-211ENST00000529899 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.39■■■□□ 2.3
TSTA3-211ENST00000529899 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.38■■■□□ 2.29
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TSTA3-211ENST00000529899 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.36■■■□□ 2.29
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TSTA3-211ENST00000529899 TSPY10P0CW01 314 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-211ENST00000529899 HSPA2P54652 639 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-211ENST00000529899 MROH2AA6NES4 1674 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-211ENST00000529899 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-211ENST00000529899 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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TSTA3-211ENST00000529899 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.17■■■□□ 2.26
TSTA3-211ENST00000529899 ZMYM3Q14202 1370 aa29.14■■■□□ 2.26
TSTA3-211ENST00000529899 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TSTA3-211ENST00000529899 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.11■■■□□ 2.25
TSTA3-211ENST00000529899 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TSTA3-211ENST00000529899 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TSTA3-211ENST00000529899 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.1■■■□□ 2.25
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